RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516285.1

RNA5SP410-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 410, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP410, Length 106 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP410-201ENST00000516285 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
RNA5SP410-201ENST00000516285 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.72■■□□□ 1.39
RNA5SP410-201ENST00000516285 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
RNA5SP410-201ENST00000516285 BCANQ96GW7 911 aa23.71■■□□□ 1.39
RNA5SP410-201ENST00000516285 PPLO60437 1756 aa23.7■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 NEUROD1Q13562 356 aa23.69■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 IQGAP1P46940 1657 aa23.69■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.68■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 LTKP29376 864 aa23.67■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.67■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 ZFYVE9O95405 1425 aa23.67■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.67■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.66■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 IFT172Q9UG01 1749 aa23.66■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.65■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RNA5SP410-201ENST00000516285 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.62■■□□□ 1.37
RNA5SP410-201ENST00000516285 MED14O60244 1454 aa23.6■■□□□ 1.37
RNA5SP410-201ENST00000516285 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RNA5SP410-201ENST00000516285 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.57■■□□□ 1.36
RNA5SP410-201ENST00000516285 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.57■■□□□ 1.36
RNA5SP410-201ENST00000516285 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.56■■□□□ 1.36
RNA5SP410-201ENST00000516285 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.54■■□□□ 1.36
RNA5SP410-201ENST00000516285 TONSLQ96HA7 1378 aa23.52■■□□□ 1.36
RNA5SP410-201ENST00000516285 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.52■■□□□ 1.36
RNA5SP410-201ENST00000516285 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.51■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.51■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.51■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 MYOM2P54296 1465 aa23.5■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 DIP2AQ14689 1571 aa23.5■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.47■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 ALKQ9UM73 1620 aa23.46■■□□□ 1.35
RNA5SP410-201ENST00000516285 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.45■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 LAMC1P11047 1609 aa23.44■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 PIK3C2GO75747 1445 aa23.43■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 STAC3Q96MF2 364 aa23.43■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 TBX22Q9Y458 520 aa23.43■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.41■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.41■■□□□ 1.34
RNA5SP410-201ENST00000516285 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.37■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 METP08581 1390 aa23.37■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.35■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 NWD1Q149M9 1564 aa23.35■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.34■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 PIK3R4Q99570 1358 aa23.34■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 CPS1P31327 1500 aa23.33■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 KCNA6P17658 529 aa23.33■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.33■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RNA5SP410-201ENST00000516285 STK26Q9P289 416 aa23.32■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.32■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.32■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.31■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 PTPRUQ92729 1446 aa23.31■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.3■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.29■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.27■■□□□ 1.32
RNA5SP410-201ENST00000516285 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.25■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 C14orf37Q86TY3 774 aa23.25■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.24■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 ADGRB1O14514 1584 aa23.24■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.23■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.22■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 CERKQ8TCT0 537 aa23.21■■□□□ 1.31
RNA5SP410-201ENST00000516285 TMEM94Q12767 1356 aa23.2■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.18■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 PTCH1Q13635 1447 aa23.18■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.18■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 ABCC11Q96J66 1382 aa23.17■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 POGKQ9P215 609 aa23.17■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.16■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 TECPR2O15040 1411 aa23.16■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.15■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 DLC1Q96QB1 1528 aa23.14■■□□□ 1.3
RNA5SP410-201ENST00000516285 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.14■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 MSH6P52701 1360 aa23.14■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 PRAM1Q96QH2 718 aa23.13■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.12■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.11■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.1■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.09■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.09■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RNA5SP410-201ENST00000516285 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms