RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC24A1O60721 1099 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 PPLO60437 1756 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 SYNMO15061 1565 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 PIK3C2BO00750 1634 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-229ENST00000515802 NOS1P29475 1434 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 TMF1P82094 1093 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-229ENST00000515802 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 REREQ9P2R6 1566 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 PIK3C2GO75747 1445 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 MYOM1P52179 1685 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 RALBP1Q15311 655 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 PANK3Q9H999 370 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-229ENST00000515802 AGLP35573 1532 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 ADGRB1O14514 1584 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 TMC1Q8TDI8 760 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 ERVK-7P63135 1459 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 IDI1Q13907 227 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 CDCA8Q53HL2 280 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-229ENST00000515802 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 FKBP8Q14318 412 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 NLRP13Q86W25 1043 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
SH3BP2-229ENST00000515802 ZFYVE9O95405 1425 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 NEFLP07196 543 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 BCANQ96GW7 911 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-229ENST00000515802 MLECQ14165 292 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-229ENST00000515802 PPP2R1AP30153 589 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 ALKQ9UM73 1620 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 INSRP06213 1382 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 PTPRMP28827 1452 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 NUDCQ9Y266 331 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 ZMYM3Q14202 1370 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 STK26Q9P289 416 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 USP32Q8NFA0 1604 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 EVC2Q86UK5 1308 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-229ENST00000515802 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.15■□□□□ 0.82
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