RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 GGT6Q6P531 493 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMYM3Q14202 1370 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC3O15438 1527 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 TESK2Q96S53 571 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 NPATQ14207 1427 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MYOM2P54296 1465 aa14.89□□□□□ -0.03
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SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC184Q52MB2 194 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ILDR2Q71H61 639 aa14.86□□□□□ -0.03
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SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MROH2AA6NES4 1674 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF1BO60333 1816 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IQGAP1P46940 1657 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 IFT172Q9UG01 1749 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP2-209ENST00000504450 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TMF1P82094 1093 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PIK3C2BO00750 1634 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNMO15061 1565 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MRS2Q9HD23 443 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RALBP1Q15311 655 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PIK3C2GO75747 1445 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 TNRQ92752 1358 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 SOCS7O14512 581 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP2-209ENST00000504450 IDI1Q13907 227 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC24A1O60721 1099 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PIP4K2BP78356 416 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFYVE9O95405 1425 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 CDCA8Q53HL2 280 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PANK3Q9H999 370 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRB1O14514 1584 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.71□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.71□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ERVK-7P63135 1459 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.67□□□□□ -0.06
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.66□□□□□ -0.06
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SH3BP2-209ENST00000504450 HSPA1LP34931 641 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP13Q86W25 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TMC1Q8TDI8 760 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-209ENST00000504450 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TOM1O60784 492 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP2-209ENST00000504450 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP1Q9C000 1473 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 MYOM1P52179 1685 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CPS1P31327 1500 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 INSRP06213 1382 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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