RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
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RABGGTB-214ENST00000497648 PHF14O94880 888 aa11.73□□□□□ -0.53
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RABGGTB-214ENST00000497648 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-214ENST00000497648 DDX12PQ92771 950 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-214ENST00000497648 NEUROD1Q13562 356 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 SAMD9Q5K651 1589 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.69□□□□□ -0.54
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