RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 HSPA1LP34931 641 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.43e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-213ENST00000496055 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CNPY4Q8N129 248 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF15Q9NS87 1388 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 MBD5Q9P267 1494 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 PLXNC1O60486 1568 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 TIAM1Q13009 1591 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ILDR2Q71H61 639 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 TICAM2Q86XR7 235 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF592Q92610 1267 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 STRCQ7RTU9 1775 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 MSH6P52701 1360 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 IL27Q8NEV9 243 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 ATF3P18847 181 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 ERBINQ96RT1 1412 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNA6P17658 529 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K1Q13233 1512 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-7P63135 1459 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 MED14O60244 1454 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC3O15438 1527 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 DEPDC5O75140 1603 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 WWC1Q8IX03 1113 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNMO15061 1565 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 IDI1Q13907 227 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM94Q12767 1356 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 DAPK1P53355 1430 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 SLAIN2Q9P270 581 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 TBX22Q9Y458 520 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGGTB-213ENST00000496055 JCADQ9P266 1359 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 IQGAP1P46940 1657 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 LTKP29376 864 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB22O15209 634 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 CLSTN1O94985 981 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGAEP38570 1179 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC5O15440 1437 aa6.2□□□□□ -1.42
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