RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRT4-205ENST00000489835 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 PREX1Q8TCU6 1659 aa24■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 PIK3C2BO00750 1634 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 IFT172Q9UG01 1749 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 ANP32CO43423 234 aa23.95■■□□□ 1.43
PRRT4-205ENST00000489835 ERVK-7P63135 1459 aa23.95■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 MYOM2P54296 1465 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 ZMYM3Q14202 1370 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 LAMC1P11047 1609 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 PPLO60437 1756 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT4-205ENST00000489835 TESK2Q96S53 571 aa23.89■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.88■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.87■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.86■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.85■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 PIK3C2GO75747 1445 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.84■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.83■■□□□ 1.41
PRRT4-205ENST00000489835 IQGAP1P46940 1657 aa23.83■■□□□ 1.4
PRRT4-205ENST00000489835 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.81■■□□□ 1.4
PRRT4-205ENST00000489835 TMF1P82094 1093 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRT4-205ENST00000489835 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.79■■□□□ 1.4
PRRT4-205ENST00000489835 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 TNRQ92752 1358 aa23.75■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 CCER2I3L3R5 266 aa23.73■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRB1O14514 1584 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 ZFYVE9O95405 1425 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.71■■□□□ 1.39
PRRT4-205ENST00000489835 STK26Q9P289 416 aa23.7■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.69■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.68■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC184Q52MB2 194 aa23.67■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 C3P01024 1663 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 PANK3Q9H999 370 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT4-205ENST00000489835 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 BCANQ96GW7 911 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 FKBP8Q14318 412 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 CDCA8Q53HL2 280 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 ALKQ9UM73 1620 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.58■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
PRRT4-205ENST00000489835 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 MRS2Q9HD23 443 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 LTKP29376 864 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 PTPRMP28827 1452 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 NLRP1Q9C000 1473 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 SLC24A1O60721 1099 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 PRAM1Q96QH2 718 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRT4-205ENST00000489835 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 POGKQ9P215 609 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 NEFLP07196 543 aa23.5■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 METP08581 1390 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 MYOM1P52179 1685 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 TMC1Q8TDI8 760 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 CABP2Q9NPB3 220 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 EVC2Q86UK5 1308 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 RALBP1Q15311 655 aa23.45■■□□□ 1.35
PRRT4-205ENST00000489835 EID1Q9Y6B2 187 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT4-205ENST00000489835 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PRRT4-205ENST00000489835 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.44■■□□□ 1.34
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