RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.41■■■□□ 2.14
NISCH-209ENST00000485765 TRPM2O94759 1503 aa28.4■■■□□ 2.14
NISCH-209ENST00000485765 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.4■■■□□ 2.14
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.37■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.36■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.35■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 CLTCL1P53675 1640 aa28.34■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 HRCP23327 699 aa28.34■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 FOXD1Q16676 465 aa28.33■■■□□ 2.13
NISCH-209ENST00000485765 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.32■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 KCNA6P17658 529 aa28.29■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 BCANQ96GW7 911 aa28.29■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 TBX22Q9Y458 520 aa28.29■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.28■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
NISCH-209ENST00000485765 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.24■■■□□ 2.11
NISCH-209ENST00000485765 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.23■■■□□ 2.11
NISCH-209ENST00000485765 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
NISCH-209ENST00000485765 KIF1BO60333 1816 aa28.21■■■□□ 2.11
NISCH-209ENST00000485765 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.2■■■□□ 2.11
NISCH-209ENST00000485765 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.19■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.18■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 PIK3R4Q99570 1358 aa28.17■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 TOM1O60784 492 aa28.17■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 DIP2AQ14689 1571 aa28.16■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 NWD1Q149M9 1564 aa28.16■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.14■■■□□ 2.1
NISCH-209ENST00000485765 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 TMEM94Q12767 1356 aa28.11■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.11■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 ALKQ9UM73 1620 aa28.09■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.09■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
NISCH-209ENST00000485765 PTPRUQ92729 1446 aa28.07■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 RGL3Q3MIN7 710 aa28.06■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.06■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 METP08581 1390 aa28.05■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.03■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 PIP4K2BP78356 416 aa28.03■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 PPLO60437 1756 aa28.03■■■□□ 2.08
NISCH-209ENST00000485765 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.99■■■□□ 2.07
NISCH-209ENST00000485765 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
NISCH-209ENST00000485765 MSH6P52701 1360 aa27.95■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 IFT172Q9UG01 1749 aa27.93■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 HSPA1LP34931 641 aa27.91■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.91■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.9■■■□□ 2.06
NISCH-209ENST00000485765 PIK3C2GO75747 1445 aa27.88■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.87■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 SLAIN2Q9P270 581 aa27.87■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.87■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 MYOM2P54296 1465 aa27.85■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 C14orf37Q86TY3 774 aa27.85■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.83■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 STAC3Q96MF2 364 aa27.83■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 PTCH1Q13635 1447 aa27.83■■■□□ 2.05
NISCH-209ENST00000485765 ATF3P18847 181 aa27.81■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.81■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 DCCP43146 1447 aa27.79■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.78■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.78■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 ABCC11Q96J66 1382 aa27.77■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.77■■■□□ 2.04
NISCH-209ENST00000485765 TECPR2O15040 1411 aa27.75■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.75■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.75■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.74■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.73■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 SIRT1Q96EB6 747 aa27.72■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 STK26Q9P289 416 aa27.72■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
NISCH-209ENST00000485765 MST1RQ04912 1400 aa27.67■■■□□ 2.02
NISCH-209ENST00000485765 LAMC1P11047 1609 aa27.67■■■□□ 2.02
NISCH-209ENST00000485765 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.67■■■□□ 2.02
NISCH-209ENST00000485765 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.67■■■□□ 2.02
NISCH-209ENST00000485765 BRINP3Q76B58 766 aa27.65■■■□□ 2.02
NISCH-209ENST00000485765 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.64■■■□□ 2.01
NISCH-209ENST00000485765 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.63■■■□□ 2.01
NISCH-209ENST00000485765 ADGRB1O14514 1584 aa27.62■■■□□ 2.01
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.61■■■□□ 2.01
NISCH-209ENST00000485765 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.59■■■□□ 2.01
NISCH-209ENST00000485765 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.57■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.57■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 DLC1Q96QB1 1528 aa27.56■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 PHLPP1O60346 1717 aa27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms