RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.82□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 ARSIQ5FYB1 569 aa5.81□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 NCOA1Q15788 1441 aa5.81□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.8□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 TBC1D12O60347 775 aa5.8□□□□□ -1.48
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TNS1-215ENST00000480416 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 TOM1O60784 492 aa5.79□□□□□ -1.48
TNS1-215ENST00000480416 PPP1R37O75864 691 aa5.79□□□□□ -1.48
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TNS1-215ENST00000480416 C3P01024 1663 aa5.79□□□□□ -1.48
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TNS1-215ENST00000480416 PTGER2P43116 358 aa5.78□□□□□ -1.48
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TNS1-215ENST00000480416 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.78□□□□□ -1.48
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TNS1-215ENST00000480416 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.77□□□□□ -1.49
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TNS1-215ENST00000480416 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.76□□□□□ -1.49
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TNS1-215ENST00000480416 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.75□□□□□ -1.49
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TNS1-215ENST00000480416 AFAP1Q8N556 730 aa5.75□□□□□ -1.49
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TNS1-215ENST00000480416 GOLGA3Q08378 1498 aa5.72□□□□□ -1.49
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TNS1-215ENST00000480416 LHX6Q9UPM6 363 aa5.72□□□□□ -1.49
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TNS1-215ENST00000480416 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
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TNS1-215ENST00000480416 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa5.7□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa5.7□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.7□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa5.7□□□□□ -1.5
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TNS1-215ENST00000480416 PLCH2O75038 1416 aa5.68□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 ARHGAP33O14559 1287 aa5.68□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 PTPRKQ15262 1439 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 PLA2R1Q13018 1463 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 OXER1Q8TDS5 423 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 STAC3Q96MF2 364 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 CPS1P31327 1500 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 STRCP1A6NGW2 1772 aa5.67□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 ABCA6Q8N139 1617 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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TNS1-215ENST00000480416 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.66□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.65□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 TK2O00142 265 aa5.65□□□□□ -1.5
TNS1-215ENST00000480416 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 MYO3AQ8NEV4 1616 aa5.65□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 NPATQ14207 1427 aa5.65□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 AGLP35573 1532 aa5.64□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.64□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 MAP3K9P80192 1104 aa5.64□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 GGT6Q6P531 493 aa5.64□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
TNS1-215ENST00000480416 KDM5CP41229 1560 aa5.63□□□□□ -1.51
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