RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FOXD1Q16676 465 aa31.18■■■□□ 2.58
ACTB-211ENST00000480301 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
ACTB-211ENST00000480301 CLTCL1P53675 1640 aa31.15■■■□□ 2.58
ACTB-211ENST00000480301 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.573e-11■■■■□ 24.1
ACTB-211ENST00000480301 HRCP23327 699 aa31.12■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.1■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.09■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.08■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 CPS1P31327 1500 aa31.08■■■□□ 2.57
ACTB-211ENST00000480301 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
ACTB-211ENST00000480301 BCANQ96GW7 911 aa31.06■■■□□ 2.56
ACTB-211ENST00000480301 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
ACTB-211ENST00000480301 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.02■■■□□ 2.56
ACTB-211ENST00000480301 KIF1BO60333 1816 aa31■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.99■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 TBX22Q9Y458 520 aa30.99■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 KCNA6P17658 529 aa30.98■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.98■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.96■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.96■■■□□ 2.55
ACTB-211ENST00000480301 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.93■■■□□ 2.54
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.9■■■□□ 2.54
ACTB-211ENST00000480301 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.88■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.88■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 DIP2AQ14689 1571 aa30.87■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 RGL3Q3MIN7 710 aa30.86■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 NWD1Q149M9 1564 aa30.86■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.86■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.86■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 PIK3R4Q99570 1358 aa30.84■■■□□ 2.53
ACTB-211ENST00000480301 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 TMEM94Q12767 1356 aa30.81■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 TOM1O60784 492 aa30.79■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 PTPRUQ92729 1446 aa30.79■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 PPLO60437 1756 aa30.79■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 METP08581 1390 aa30.78■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.77■■■□□ 2.52
ACTB-211ENST00000480301 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
ACTB-211ENST00000480301 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.75■■■□□ 2.51
ACTB-211ENST00000480301 ALKQ9UM73 1620 aa30.74■■■□□ 2.51
ACTB-211ENST00000480301 PIP4K2BP78356 416 aa30.69■■■□□ 2.5
ACTB-211ENST00000480301 IFT172Q9UG01 1749 aa30.69■■■□□ 2.5
ACTB-211ENST00000480301 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.65■■■□□ 2.5
ACTB-211ENST00000480301 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
ACTB-211ENST00000480301 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
ACTB-211ENST00000480301 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
ACTB-211ENST00000480301 PIK3C2GO75747 1445 aa30.62■■■□□ 2.49
ACTB-211ENST00000480301 MSH6P52701 1360 aa30.61■■■□□ 2.49
ACTB-211ENST00000480301 MYOM2P54296 1465 aa30.6■■■□□ 2.49
ACTB-211ENST00000480301 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.6■■■□□ 2.49
ACTB-211ENST00000480301 C14orf37Q86TY3 774 aa30.56■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.56■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.55■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 HSPA1LP34931 641 aa30.53■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.53■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.53■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.53■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.52■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.52■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 PTCH1Q13635 1447 aa30.52■■■□□ 2.48
ACTB-211ENST00000480301 STAC3Q96MF2 364 aa30.51■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.5■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 SLAIN2Q9P270 581 aa30.5■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.5■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.47■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 ATF3P18847 181 aa30.46■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 STK26Q9P289 416 aa30.46■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 ABCC11Q96J66 1382 aa30.45■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.45■■■□□ 2.47
ACTB-211ENST00000480301 TECPR2O15040 1411 aa30.44■■■□□ 2.46
ACTB-211ENST00000480301 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.44■■■□□ 2.46
ACTB-211ENST00000480301 DCCP43146 1447 aa30.43■■■□□ 2.46
ACTB-211ENST00000480301 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
ACTB-211ENST00000480301 LAMC1P11047 1609 aa30.4■■■□□ 2.46
ACTB-211ENST00000480301 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.38■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.38■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.36■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 NEUROD1Q13562 356 aa30.36■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 SIRT1Q96EB6 747 aa30.36■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 ADGRB1O14514 1584 aa30.35■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 MST1RQ04912 1400 aa30.34■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.34■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.34■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.33■■■□□ 2.45
ACTB-211ENST00000480301 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.3■■■□□ 2.44
ACTB-211ENST00000480301 BRINP3Q76B58 766 aa30.29■■■□□ 2.44
ACTB-211ENST00000480301 PRAM1Q96QH2 718 aa30.25■■■□□ 2.43
ACTB-211ENST00000480301 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.25■■■□□ 2.43
ACTB-211ENST00000480301 DLC1Q96QB1 1528 aa30.25■■■□□ 2.43
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