RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.14■□□□□ 0.97
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC7Q96M83 1385 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RIPK4P57078 832 aa20.86■□□□□ 0.93
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LNPKQ9C0E8 428 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRIN2AQ12879 1464 aa20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NGEFQ8N5V2 710 aa20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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