RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 WWC1Q8IX03 1113 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 HECW1Q76N89 1606 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 TICAM2Q86XR7 235 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 APPP05067 770 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP14P50281 582 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM193AP78312 1265 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP10AO60312 1499 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 MCCP23508 829 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 C3P01024 1663 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 CLSTN1O94985 981 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 NCOA1Q15788 1441 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 SAMD9Q5K651 1589 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 VGLL3A8MV65 326 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 MS4A1P11836 297 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC20A2Q08357 652 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-208ENST00000471759 ESPNB1AK53 854 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PHF14O94880 888 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 P3H3Q8IVL6 736 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 REREQ9P2R6 1566 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE4AP27815 886 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PRXQ9BXM0 1461 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 RGL2O15211 777 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 YY1AP1Q9H869 796 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 BACH2Q9BYV9 841 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP120Q8N960 986 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 KDM5CP41229 1560 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCH2O75038 1416 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 HSPA1LP34931 641 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 AGLP35573 1532 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 MROH2AA6NES4 1674 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCA6Q8N139 1617 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-208ENST00000471759 DYNC1I1O14576 645 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 PSEN1P49768 467 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 MRE11P49959 708 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 RALBP1Q15311 655 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 OFD1O75665 1012 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2R1Q13018 1463 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 NPATQ14207 1427 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF592Q92610 1267 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 RIPK4P57078 832 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 PIP4K2BP78356 416 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms