RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.89■■■■□ 3.18
OPN3-204ENST00000469376 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.89■■■■□ 3.18
OPN3-204ENST00000469376 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.88■■■■□ 3.17
OPN3-204ENST00000469376 CEP152O94986 1710 aa34.85■■■■□ 3.17
OPN3-204ENST00000469376 ABCC3O15438 1527 aa34.83■■■■□ 3.17
OPN3-204ENST00000469376 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.81■■■■□ 3.16
OPN3-204ENST00000469376 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.8■■■■□ 3.16
OPN3-204ENST00000469376 MSH5O43196 834 aa34.8■■■■□ 3.16
OPN3-204ENST00000469376 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.79■■■■□ 3.16
OPN3-204ENST00000469376 MLECQ14165 292 aa34.78■■■■□ 3.16
OPN3-204ENST00000469376 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
OPN3-204ENST00000469376 NLRP13Q86W25 1043 aa34.76■■■■□ 3.15
OPN3-204ENST00000469376 RGL3Q3MIN7 710 aa34.73■■■■□ 3.15
OPN3-204ENST00000469376 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.72■■■■□ 3.15
OPN3-204ENST00000469376 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.72■■■■□ 3.15
OPN3-204ENST00000469376 PTPRTO14522 1441 aa34.71■■■■□ 3.15
OPN3-204ENST00000469376 NPATQ14207 1427 aa34.71■■■■□ 3.15
OPN3-204ENST00000469376 INSRP06213 1382 aa34.69■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.68■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.67■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 TRPM2O94759 1503 aa34.66■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 TESK2Q96S53 571 aa34.66■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 CCDC136Q96JN2 1154 aa34.64■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 PDE3BQ13370 1112 aa34.63■■■■□ 3.14
OPN3-204ENST00000469376 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.62■■■■□ 3.13
OPN3-204ENST00000469376 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
OPN3-204ENST00000469376 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
OPN3-204ENST00000469376 TMF1P82094 1093 aa34.6■■■■□ 3.13
OPN3-204ENST00000469376 ERICH6Q7L0X2 663 aa34.59■■■■□ 3.13
OPN3-204ENST00000469376 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 NOS1P29475 1434 aa34.55■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 CLTCL1P53675 1640 aa34.54■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 MADDQ8WXG6 1647 aa34.53■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 RRP1P56182 461 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 STAC3Q96MF2 364 aa34.51■■■■□ 3.12
OPN3-204ENST00000469376 IQGAP1P46940 1657 aa34.5■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 PANK3Q9H999 370 aa34.49■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 ZMYM3Q14202 1370 aa34.49■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.49■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 RCAN3Q9UKA8 241 aa34.48■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.47■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.47■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 SYNMO15061 1565 aa34.45■■■■□ 3.11
OPN3-204ENST00000469376 ERVK-7P63135 1459 aa34.44■■■■□ 3.1
OPN3-204ENST00000469376 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
OPN3-204ENST00000469376 MROH2AA6NES4 1674 aa34.4■■■■□ 3.1
OPN3-204ENST00000469376 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.39■■■■□ 3.1
OPN3-204ENST00000469376 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.38■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.38■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 PIK3C2BO00750 1634 aa34.37■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.37■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 KIF1BO60333 1816 aa34.37■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 CDCA8Q53HL2 280 aa34.36■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 IDI1Q13907 227 aa34.35■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.33■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
OPN3-204ENST00000469376 EXOC6Q8TAG9 804 aa34.31■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 ADGRB3O60242 1522 aa34.3■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.27■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.27■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
OPN3-204ENST00000469376 C3P01024 1663 aa34.26■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.25■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 TNRQ92752 1358 aa34.24■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.22■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.22■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
OPN3-204ENST00000469376 MYOM1P52179 1685 aa34.2■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 PPP2R1AP30153 589 aa34.2■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.2■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 PIK3C2GO75747 1445 aa34.18■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 SLC24A1O60721 1099 aa34.18■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.18■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 MYOM2P54296 1465 aa34.18■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.17■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.16■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.15■■■■□ 3.06
OPN3-204ENST00000469376 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.065e-6■□□□□ 10.2
OPN3-204ENST00000469376 IFT172Q9UG01 1749 aa34.13■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 MS4A1P11836 297 aa34.12■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.1■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.08■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 NLRP1Q9C000 1473 aa34.08■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 PPLO60437 1756 aa34.08■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.07■■■■□ 3.05
OPN3-204ENST00000469376 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.06■■■■□ 3.04
OPN3-204ENST00000469376 ZNF521Q96K83 1311 aa34.04■■■■□ 3.04
OPN3-204ENST00000469376 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
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