RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.92■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 FBLN2P98095 1184 aa22.9■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.9■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 TNNQ9UQP3 1299 aa22.9■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PREB-208ENST00000468045 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.89■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.87■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 NLRP1Q9C000 1473 aa22.86■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 NEUROD2Q15784 382 aa22.86■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 ZMYND15Q9H091 742 aa22.85■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.85■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.85■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.84■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.84■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.83■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.83■■□□□ 1.25
PREB-208ENST00000468045 E9PSI1 815 aa22.83■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.82■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.81■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.81■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 RLBP1P12271 317 aa22.8■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.8■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 GRIN2AQ12879 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 MCM4P33991 863 aa22.79■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 PDE3AQ14432 1141 aa22.78■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 PLEKHG5O94827 1062 aa22.78■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 FSD2A1L4K1 749 aa22.77■■□□□ 1.24
PREB-208ENST00000468045 JPH4Q96JJ6 628 aa22.76■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.76■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 ATP10BO94823 1461 aa22.75■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 WWC1Q8IX03 1113 aa22.74■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.74■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 TRAK2O60296 914 aa22.73■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.72■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 CLCN1P35523 988 aa22.71■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.71■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 PIK3C2GO75747 1445 aa22.71■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 LAMC1P11047 1609 aa22.7■■□□□ 1.23
PREB-208ENST00000468045 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.7■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 ERBB4Q15303 1308 aa22.68■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.68■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.68■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 SYNJ2O15056 1496 aa22.67■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.66■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.66■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.64■■□□□ 1.22
PREB-208ENST00000468045 ABCC2Q92887 1545 aa22.64■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.64■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 CDCA8Q53HL2 280 aa22.63■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.63■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.63■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 ABCA8O94911 1581 aa22.63■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.63■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 NUP160Q12769 1436 aa22.63■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.61■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 MRE11P49959 708 aa22.61■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.61■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.61■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.6■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 IFT140Q96RY7 1462 aa22.59■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 ESPNB1AK53 854 aa22.59■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 SYNMO15061 1565 aa22.59■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.59■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PREB-208ENST00000468045 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.57■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.57■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.56■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.56■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 MYOM1P52179 1685 aa22.55■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 UNC13BO14795 1591 aa22.55■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.54■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.54■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 HSCBQ8IWL3 235 aa22.54■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 IQGAP1P46940 1657 aa22.53■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.53■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 MADDQ8WXG6 1647 aa22.52■■□□□ 1.2
PREB-208ENST00000468045 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PREB-208ENST00000468045 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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