RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-209ENST00000466244 FOXD1Q16676 465 aa22.36■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.33■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 CPS1P31327 1500 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 CERKQ8TCT0 537 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 DIP2AQ14689 1571 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB17-209ENST00000466244 NWD1Q149M9 1564 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB17-209ENST00000466244 PPLO60437 1756 aa22.25■■□□□ 1.15
RAB17-209ENST00000466244 IFT172Q9UG01 1749 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB17-209ENST00000466244 TBX22Q9Y458 520 aa22.24■■□□□ 1.15
RAB17-209ENST00000466244 PIK3R4Q99570 1358 aa22.22■■□□□ 1.15
RAB17-209ENST00000466244 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB17-209ENST00000466244 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 KCNA6P17658 529 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 MYOM2P54296 1465 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 FBXO41Q8TF61 875 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB17-209ENST00000466244 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 PIK3C2GO75747 1445 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 PTPRUQ92729 1446 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 ALKQ9UM73 1620 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 METP08581 1390 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 RGL3Q3MIN7 710 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 BCANQ96GW7 911 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB17-209ENST00000466244 STAC3Q96MF2 364 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 TMEM94Q12767 1356 aa22.05■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 LAMC1P11047 1609 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.02■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 PTCH1Q13635 1447 aa22.02■■□□□ 1.12
RAB17-209ENST00000466244 TECPR2O15040 1411 aa22■■□□□ 1.11
RAB17-209ENST00000466244 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RAB17-209ENST00000466244 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RAB17-209ENST00000466244 ADGRB1O14514 1584 aa21.96■■□□□ 1.11
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RAB17-209ENST00000466244 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.94■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 ABCC11Q96J66 1382 aa21.94■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 TOM1O60784 492 aa21.93■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 DCCP43146 1447 aa21.93■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.93■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.93■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 MSH6P52701 1360 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
RAB17-209ENST00000466244 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB17-209ENST00000466244 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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RAB17-209ENST00000466244 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB17-209ENST00000466244 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB17-209ENST00000466244 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB17-209ENST00000466244 DLC1Q96QB1 1528 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB17-209ENST00000466244 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.86■■□□□ 1.09
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RAB17-209ENST00000466244 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.84■■□□□ 1.09
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RAB17-209ENST00000466244 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.81■■□□□ 1.08
RAB17-209ENST00000466244 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.81■■□□□ 1.08
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RAB17-209ENST00000466244 SLAIN2Q9P270 581 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB17-209ENST00000466244 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
RAB17-209ENST00000466244 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB17-209ENST00000466244 NEUROD1Q13562 356 aa21.77■■□□□ 1.08
RAB17-209ENST00000466244 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.77■■□□□ 1.07
RAB17-209ENST00000466244 PIP4K2BP78356 416 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB17-209ENST00000466244 STK26Q9P289 416 aa21.76■■□□□ 1.07
RAB17-209ENST00000466244 ADGRB2O60241 1585 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB17-209ENST00000466244 ATF3P18847 181 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB17-209ENST00000466244 C14orf37Q86TY3 774 aa21.75■■□□□ 1.07
RAB17-209ENST00000466244 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.74■■□□□ 1.07
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