RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.45■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFYVE9O95405 1425 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRPM2O94759 1503 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLTCL1P53675 1640 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXD1Q16676 465 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNA6P17658 529 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOM1O60784 492 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF1BO60333 1816 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBX22Q9Y458 520 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DIP2AQ14689 1571 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HRCP23327 699 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIP4K2BP78356 416 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM94Q12767 1356 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIK3R4Q99570 1358 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NWD1Q149M9 1564 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGL3Q3MIN7 710 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C14orf37Q86TY3 774 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MSH6P52701 1360 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ILDR2Q71H61 639 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.01■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-204ENST00000466037 METP08581 1390 aa29■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPLO60437 1756 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTPRUQ92729 1446 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALKQ9UM73 1620 aa28.95■■■□□ 2.23
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSPA1LP34931 641 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATF3P18847 181 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLAIN2Q9P270 581 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFT172Q9UG01 1749 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOCS7O14512 581 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIK3C2GO75747 1445 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYOM2P54296 1465 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTCH1Q13635 1447 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCCP43146 1447 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STK26Q9P289 416 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STAC3Q96MF2 364 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LAMC1P11047 1609 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCC11Q96J66 1382 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TECPR2O15040 1411 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MST1RQ04912 1400 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRINP3Q76B58 766 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIRT1Q96EB6 747 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHLPP1O60346 1717 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEUROD1Q13562 356 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POGKQ9P215 609 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms