RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.21■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
RPRD1B-202ENST00000449186 RGL3Q3MIN7 710 aa16.2■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 IQGAP1P46940 1657 aa16.2■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 MED14O60244 1454 aa16.19■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.19■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 EID1Q9Y6B2 187 aa16.18■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.18■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.17■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.16■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.16■□□□□ 0.18
RPRD1B-202ENST00000449186 PPLO60437 1756 aa16.14■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 BCANQ96GW7 911 aa16.14■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.13■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.13■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.12■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.11■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 IFT172Q9UG01 1749 aa16.11■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.11■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.11■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 NEUROD1Q13562 356 aa16.1■□□□□ 0.17
RPRD1B-202ENST00000449186 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.07■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.07■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.05■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPRUQ92729 1446 aa16.04■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 METP08581 1390 aa16.04■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.04■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 TBX22Q9Y458 520 aa16.03■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 ALKQ9UM73 1620 aa16.02■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 CERKQ8TCT0 537 aa16.02■□□□□ 0.16
RPRD1B-202ENST00000449186 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.01■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNA6P17658 529 aa16■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 PIK3C2GO75747 1445 aa16■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 MYOM2P54296 1465 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 DIP2AQ14689 1571 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 NWD1Q149M9 1564 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.99■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.98■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 CPS1P31327 1500 aa15.96■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 STK26Q9P289 416 aa15.94■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM94Q12767 1356 aa15.94■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 PIK3R4Q99570 1358 aa15.92■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.92■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.91■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.91■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.91■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGRB1O14514 1584 aa15.9■□□□□ 0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 TONSLQ96HA7 1378 aa15.89■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.88■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 LAMC1P11047 1609 aa15.88■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.88■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.86■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.85■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.85■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 C14orf37Q86TY3 774 aa15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 STAC3Q96MF2 364 aa15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC11Q96J66 1382 aa15.84■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.83■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 TECPR2O15040 1411 aa15.83■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 PTCH1Q13635 1447 aa15.83■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.82■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 PIP4K2BP78356 416 aa15.82■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.82■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 FBXO41Q8TF61 875 aa15.81■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 PRAM1Q96QH2 718 aa15.81■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 MSH6P52701 1360 aa15.79■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.78■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.78■□□□□ 0.12
RPRD1B-202ENST00000449186 DLC1Q96QB1 1528 aa15.77■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 TOM1O60784 492 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms