RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOM1O60784 492 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCC1P33527 1531 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEAQ6S8J7 498 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STK24Q9Y6E0 443 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRKQ15262 1439 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZMYM3Q14202 1370 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFNL1Q8IU54 200 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PREX2Q70Z35 1606 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEIP0CG38 1075 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NBR1Q14596 966 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNMO15061 1565 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIE1P35590 1138 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLXNC1O60486 1568 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQGAP1P46940 1657 aa9.27□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.27□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSEN1P49768 467 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLGA2Q08379 1002 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEPDC5O75140 1603 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP7AQ04656 1500 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MED14O60244 1454 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A2MP01023 1474 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.18□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNRQ92752 1358 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.17□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLIP1P30622 1438 aa9.16□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHLPP1O60346 1717 aa9.16□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GGT6Q6P531 493 aa9.15□□□□□ -0.94
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PZPP20742 1482 aa9.15□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRP6O75581 1613 aa9.15□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IER5LQ5T953 404 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM52Q96A61 297 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPC6Q9Y210 931 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CABP2Q9NPB3 220 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP3K1Q13233 1512 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC39A7Q92504 469 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FMN1Q68DA7 1419 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOX12O15370 315 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C7P10643 843 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C14orf37Q86TY3 774 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NLRP1Q9C000 1473 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.1□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFRPQ9BY79 579 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIA2Q96PC5 1412 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEC24BO95487 1268 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms