RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPS2Q13227 327 aa18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMARCA4P51532 1647 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APAF1O14727 1248 aa18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STAC3Q96MF2 364 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDE4CQ08493 712 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS53Q5VIR6 699 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MCTP1Q6DN14 999 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM29Q14134 588 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CUX1P39880 1505 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEFQ10587 303 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AAMPQ13685 434 aa18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUTM2FA1L443 756 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RUNDC1Q96C34 613 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF20Q5VTR2 975 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUCB2P80303 420 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RIPK4P57078 832 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF592Q92610 1267 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC7Q96M83 1385 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EVA1CP58658 441 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRM3Q9NNZ6 103 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BICD2Q8TD16 824 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CPLX1O14810 134 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MIA2Q96PC5 1412 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX35Q5T0J7 233 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNAI1P63096 354 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.11■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.11■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERC2O15083 957 aa18.11■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRDNQ13061 729 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOMER1Q86YM7 354 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDC45O75419 566 aa18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APPP05067 770 aa18.08■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.07■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.07■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.07■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERICH2A1L162 156 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NECTIN2Q92692 538 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LNPKQ9C0E8 428 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRE11P49959 708 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFKBIBQ15653 356 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSME1Q06323 249 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OSCARQ8IYS5 282 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IFT57Q9NWB7 429 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PANK1Q8TE04 598 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
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