RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLTCL1P53675 1640 aa37.24■■■■□ 3.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.13■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPS1P31327 1500 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.11■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HRCP23327 699 aa37.09■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCANQ96GW7 911 aa37.07■■■■□ 3.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF1BO60333 1816 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.01■■■■□ 3.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37■■■■□ 3.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37■■■■□ 3.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC7Q96NW7 1537 aa37■■■■□ 3.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNA6P17658 529 aa36.97■■■■□ 3.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBX22Q9Y458 520 aa36.97■■■■□ 3.51
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NWD1Q149M9 1564 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIP2AQ14689 1571 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.86■■■■□ 3.49
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGL3Q3MIN7 710 aa36.84■■■■□ 3.49
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIK3R4Q99570 1358 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM94Q12767 1356 aa36.8■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPLO60437 1756 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPRUQ92729 1446 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALKQ9UM73 1620 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 METP08581 1390 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOM1O60784 492 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFT172Q9UG01 1749 aa36.69■■■■□ 3.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIP4K2BP78356 416 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIK3C2GO75747 1445 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MSH6P52701 1360 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYOM2P54296 1465 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C14orf37Q86TY3 774 aa36.49■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPA1LP34931 641 aa36.48■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTCH1Q13635 1447 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.42■■■■□ 3.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLAIN2Q9P270 581 aa36.41■■■■□ 3.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.37■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK26Q9P289 416 aa36.37■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATF3P18847 181 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TECPR2O15040 1411 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAC3Q96MF2 364 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCCP43146 1447 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC11Q96J66 1382 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMC1P11047 1609 aa36.32■■■■□ 3.4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRB1O14514 1584 aa36.26■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.26■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MST1RQ04912 1400 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEUROD1Q13562 356 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIRT1Q96EB6 747 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRINP3Q76B58 766 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLC1Q96QB1 1528 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAM1Q96QH2 718 aa36.12■■■■□ 3.37
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