RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PANK3Q9H999 370 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 SKAP1Q86WV1 359 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF3BO15066 747 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 CRBNQ96SW2 442 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMC1P11047 1609 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 DEPDC5O75140 1603 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP10AO60312 1499 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-208ENST00000424082 TMF1P82094 1093 aa24.08■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 INSRP06213 1382 aa24.06■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.06■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.06■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.05■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.05■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEF3O95398 923 aa24.02■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.02■■□□□ 1.44
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KANK1Q14678 1352 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GSE1Q14687 1217 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TET3O43151 1660 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 NFKBIBQ15653 356 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRTO14522 1441 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPM2O94759 1503 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.95■■□□□ 1.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP2R1AP30153 589 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.94■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 NEO1Q92859 1461 aa23.94■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CLTCL1P53675 1640 aa23.94■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.93■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A3P48751 1232 aa23.92■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 GGT6Q6P531 493 aa23.91■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA6Q8N139 1617 aa23.91■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.91■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.9■■□□□ 1.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF521Q96K83 1311 aa23.89■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.88■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP152O94986 1710 aa23.88■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA2Q08379 1002 aa23.87■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 MADDQ8WXG6 1647 aa23.87■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.86■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM161AQ3B820 660 aa23.86■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 IQGAP1P46940 1657 aa23.86■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf34Q49A92 452 aa23.85■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 GLI2P10070 1586 aa23.83■■□□□ 1.41
RALGPS1-208ENST00000424082 RICTORQ6R327 1708 aa23.83■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.83■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNMO15061 1565 aa23.82■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.81■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.81■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.81■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.81■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 SLFN5Q08AF3 891 aa23.8■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 DIP2BQ9P265 1576 aa23.8■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 CDCA8Q53HL2 280 aa23.78■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3C2GO75747 1445 aa23.78■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 NPATQ14207 1427 aa23.78■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPOAP1O95153 1857 aa23.77■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS3P49796 1198 aa23.77■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOM1P52179 1685 aa23.77■■□□□ 1.4
RALGPS1-208ENST00000424082 APAF1O14727 1248 aa23.75■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC3O15438 1527 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 BCAR3O75815 825 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 MROH2AA6NES4 1674 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF1BO60333 1816 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-208ENST00000424082 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms