RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423421.5

CXorf40A-204, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-204ENST00000423421 TONSLQ96HA7 1378 aa29.51■■■□□ 2.31
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CXorf40A-204ENST00000423421 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.51■■■□□ 2.31
CXorf40A-204ENST00000423421 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.5■■■□□ 2.31
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CXorf40A-204ENST00000423421 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.47■■■□□ 2.31
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CXorf40A-204ENST00000423421 BCANQ96GW7 911 aa29.4■■■□□ 2.3
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CXorf40A-204ENST00000423421 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.39■■■□□ 2.3
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CXorf40A-204ENST00000423421 IFT172Q9UG01 1749 aa29.34■■■□□ 2.29
CXorf40A-204ENST00000423421 MED14O60244 1454 aa29.33■■■□□ 2.29
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CXorf40A-204ENST00000423421 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.29■■■□□ 2.28
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CXorf40A-204ENST00000423421 PIK3C2GO75747 1445 aa29.24■■■□□ 2.27
CXorf40A-204ENST00000423421 TBX22Q9Y458 520 aa29.23■■■□□ 2.27
CXorf40A-204ENST00000423421 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.23■■■□□ 2.27
CXorf40A-204ENST00000423421 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
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CXorf40A-204ENST00000423421 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.2■■■□□ 2.26
CXorf40A-204ENST00000423421 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
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CXorf40A-204ENST00000423421 LAMC1P11047 1609 aa29.17■■■□□ 2.26
CXorf40A-204ENST00000423421 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.15■■■□□ 2.26
CXorf40A-204ENST00000423421 ALKQ9UM73 1620 aa29.15■■■□□ 2.26
CXorf40A-204ENST00000423421 PIK3R4Q99570 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
CXorf40A-204ENST00000423421 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.14■■■□□ 2.26
CXorf40A-204ENST00000423421 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.11■■■□□ 2.25
CXorf40A-204ENST00000423421 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.11■■■□□ 2.25
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CXorf40A-204ENST00000423421 METP08581 1390 aa29.04■■■□□ 2.24
CXorf40A-204ENST00000423421 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.03■■■□□ 2.24
CXorf40A-204ENST00000423421 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.03■■■□□ 2.24
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CXorf40A-204ENST00000423421 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29■■■□□ 2.23
CXorf40A-204ENST00000423421 CARD11Q9BXL7 1154 aa29■■■□□ 2.23
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CXorf40A-204ENST00000423421 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CXorf40A-204ENST00000423421 STK26Q9P289 416 aa28.97■■■□□ 2.23
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CXorf40A-204ENST00000423421 ABCC11Q96J66 1382 aa28.96■■■□□ 2.23
CXorf40A-204ENST00000423421 ADGRB1O14514 1584 aa28.96■■■□□ 2.23
CXorf40A-204ENST00000423421 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.96■■■□□ 2.23
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CXorf40A-204ENST00000423421 SIRT1Q96EB6 747 aa28.93■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.92■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 PTPRUQ92729 1446 aa28.92■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 NWD1Q149M9 1564 aa28.91■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.91■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 TECPR2O15040 1411 aa28.9■■■□□ 2.22
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CXorf40A-204ENST00000423421 CPS1P31327 1500 aa28.9■■■□□ 2.22
CXorf40A-204ENST00000423421 PTCH1Q13635 1447 aa28.88■■■□□ 2.21
CXorf40A-204ENST00000423421 POGKQ9P215 609 aa28.88■■■□□ 2.21
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CXorf40A-204ENST00000423421 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.86■■■□□ 2.21
CXorf40A-204ENST00000423421 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.83■■■□□ 2.21
CXorf40A-204ENST00000423421 SLC24A1O60721 1099 aa28.82■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 PRAM1Q96QH2 718 aa28.82■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.81■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 C14orf37Q86TY3 774 aa28.81■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.79■■■□□ 2.2
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CXorf40A-204ENST00000423421 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.77■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 TMEM94Q12767 1356 aa28.76■■■□□ 2.2
CXorf40A-204ENST00000423421 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.76■■■□□ 2.19
CXorf40A-204ENST00000423421 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.76■■■□□ 2.19
CXorf40A-204ENST00000423421 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CXorf40A-204ENST00000423421 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
CXorf40A-204ENST00000423421 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.72■■■□□ 2.19
CXorf40A-204ENST00000423421 MSH6P52701 1360 aa28.71■■■□□ 2.19
CXorf40A-204ENST00000423421 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.7■■■□□ 2.19
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