RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 MYOM1P52179 1685 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 TET3O43151 1660 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 PDE4AP27815 886 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.56■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 STAC3Q96MF2 364 aa28.56■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 CRBNQ96SW2 442 aa28.55■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 BACH2Q9BYV9 841 aa28.55■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.54■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.53■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 AFAP1Q8N556 730 aa28.53■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.52■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 CDCA8Q53HL2 280 aa28.52■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.51■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF521Q96K83 1311 aa28.5■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 PIK3C2GO75747 1445 aa28.5■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.48■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.48■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.47■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.47■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP7AQ04656 1500 aa28.45■■■□□ 2.15
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.43■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.41■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 SKAP1Q86WV1 359 aa28.4■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.4■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.4■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 KANK1Q14678 1352 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA2Q08379 1002 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCA6Q8N139 1617 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 MYOM2P54296 1465 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 FANCAO15360 1455 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 ERVK-7P63135 1459 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 IFT172Q9UG01 1749 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 SLFN5Q08AF3 891 aa28.35■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF1BO60333 1816 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF3BO15066 747 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM200B-201ENST00000420504 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.31■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.29■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGRL1O94910 1474 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 MROH2AA6NES4 1674 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC24A1O60721 1099 aa28.27■■■□□ 2.12
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 APAF1O14727 1248 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM200B-201ENST00000420504 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGRB3O60242 1522 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 E9PSI1 815 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 NGEFQ8N5V2 710 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 USP35Q9P2H5 1018 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 C8orf34Q49A92 452 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM200B-201ENST00000420504 BCAR3O75815 825 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 NEFMP07197 916 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM161AQ3B820 660 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 NOS1P29475 1434 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 SHPRHQ149N8 1683 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 PPLO60437 1756 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 ASXL2Q76L83 1435 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.08■■■□□ 2.09
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGRB1O14514 1584 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 WWC1Q8IX03 1113 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 NPATQ14207 1427 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 RGS3P49796 1198 aa28.02■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 PDE3AQ14432 1141 aa28.02■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 USP32Q8NFA0 1604 aa28.01■■■□□ 2.08
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC4A3P48751 1232 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-201ENST00000420504 CGNL1Q0VF96 1302 aa28■■■□□ 2.07
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