RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412471.5

SLC5A6-204, Transcript of solute carrier family 5 member 6, human

TSL 5

Gene SLC5A6, Length 917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC5A6-204	ENST00000412471	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.32	■■■■■ 4.53
SLC5A6-204	ENST00000412471	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		43.32	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	KIF1B	O60333	1816 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	HRC	P23327	699 aa		43.3	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.3	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	CPS1	P31327	1500 aa		43.3	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.29	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	FOXD1	Q16676	465 aa		43.28	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.28	■■■■■ 4.52
SLC5A6-204	ENST00000412471	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
SLC5A6-204	ENST00000412471	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
SLC5A6-204	ENST00000412471	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.19	■■■■■ 4.5
SLC5A6-204	ENST00000412471	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SLC5A6-204	ENST00000412471	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SLC5A6-204	ENST00000412471	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SLC5A6-204	ENST00000412471	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
SLC5A6-204	ENST00000412471	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.13	■■■■■ 4.5
SLC5A6-204	ENST00000412471	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SLC5A6-204	ENST00000412471	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.06	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	KCNA6	P17658	529 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SLC5A6-204	ENST00000412471	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43	■■■■■ 4.47
SLC5A6-204	ENST00000412471	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SLC5A6-204	ENST00000412471	PPL	O60437	1756 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SLC5A6-204	ENST00000412471	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SLC5A6-204	ENST00000412471	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SLC5A6-204	ENST00000412471	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SLC5A6-204	ENST00000412471	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SLC5A6-204	ENST00000412471	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
SLC5A6-204	ENST00000412471	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
SLC5A6-204	ENST00000412471	TOM1	O60784	492 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SLC5A6-204	ENST00000412471	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SLC5A6-204	ENST00000412471	MET	P08581	1390 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SLC5A6-204	ENST00000412471	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
SLC5A6-204	ENST00000412471	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
SLC5A6-204	ENST00000412471	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SLC5A6-204	ENST00000412471	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SLC5A6-204	ENST00000412471	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.71	■■■■■ 4.43
SLC5A6-204	ENST00000412471	MYOM2	P54296	1465 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SLC5A6-204	ENST00000412471	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SLC5A6-204	ENST00000412471	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
SLC5A6-204	ENST00000412471	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.63	■■■■■ 4.42
SLC5A6-204	ENST00000412471	MSH6	P52701	1360 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SLC5A6-204	ENST00000412471	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SLC5A6-204	ENST00000412471	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SLC5A6-204	ENST00000412471	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
SLC5A6-204	ENST00000412471	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SLC5A6-204	ENST00000412471	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.53	■■■■■ 4.4
SLC5A6-204	ENST00000412471	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SLC5A6-204	ENST00000412471	LAMC1	P11047	1609 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SLC5A6-204	ENST00000412471	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.45	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
SLC5A6-204	ENST00000412471	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	DCC	P43146	1447 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	TECPR2	O15040	1411 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SLC5A6-204	ENST00000412471	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.38	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	ATF3	P18847	181 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	HSPA1L	P34931	641 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SLC5A6-204	ENST00000412471	STK26	Q9P289	416 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SLC5A6-204	ENST00000412471	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SLC5A6-204	ENST00000412471	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SLC5A6-204	ENST00000412471	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SLC5A6-204	ENST00000412471	MST1R	Q04912	1400 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SLC5A6-204	ENST00000412471	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.16	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SLC5A6-204	ENST00000412471	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.06	■■■■■ 4.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms