RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400299.6

SELENOM-201, Transcript of selenoprotein M, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SELENOM, Length 694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOM-201ENST00000400299 DIP2AQ14689 1571 aa25.24■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 BCANQ96GW7 911 aa25.23■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.22■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 C8orf37Q96NL8 207 aa25.22■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.22■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 IDI1Q13907 227 aa25.21■■□□□ 1.63
SELENOM-201ENST00000400299 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.2■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 C14orf37Q86TY3 774 aa25.18■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 CEP162Q5TB80 1403 aa25.18■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.18■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.16■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 BRINP3Q76B58 766 aa25.15■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.15■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.14■■□□□ 1.62
SELENOM-201ENST00000400299 ATF3P18847 181 aa25.13■■□□□ 1.61
SELENOM-201ENST00000400299 NGLY1Q96IV0 654 aa25.13■■□□□ 1.61
SELENOM-201ENST00000400299 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.11■■□□□ 1.61
SELENOM-201ENST00000400299 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.11■■□□□ 1.61
SELENOM-201ENST00000400299 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.08■■□□□ 1.61
SELENOM-201ENST00000400299 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SELENOM-201ENST00000400299 CCDC125Q86Z20 511 aa25.04■■□□□ 1.6
SELENOM-201ENST00000400299 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SELENOM-201ENST00000400299 ADAMTS2O95450 1211 aa25.03■■□□□ 1.6
SELENOM-201ENST00000400299 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.01■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 ADGRB3O60242 1522 aa25.01■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 TBX22Q9Y458 520 aa25■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 USP21Q9UK80 565 aa24.99■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.98■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 LRP5O75197 1615 aa24.97■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.97■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 ZFYVE9O95405 1425 aa24.96■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SELENOM-201ENST00000400299 NOS1P29475 1434 aa24.93■■□□□ 1.58
SELENOM-201ENST00000400299 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.92■■□□□ 1.58
SELENOM-201ENST00000400299 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.91■■□□□ 1.58
SELENOM-201ENST00000400299 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.9■■□□□ 1.58
SELENOM-201ENST00000400299 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.9■■□□□ 1.58
SELENOM-201ENST00000400299 ATRNO75882 1429 aa24.89■■□□□ 1.58
SELENOM-201ENST00000400299 KANK1Q14678 1352 aa24.89■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 KIF15Q9NS87 1388 aa24.89■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 MST1RQ04912 1400 aa24.88■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.88■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.87■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 ERBINQ96RT1 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.84■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 DCCP43146 1447 aa24.84■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 PTPRUQ92729 1446 aa24.84■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SELENOM-201ENST00000400299 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.82■■□□□ 1.56
SELENOM-201ENST00000400299 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SELENOM-201ENST00000400299 PIK3R4Q99570 1358 aa24.81■■□□□ 1.56
SELENOM-201ENST00000400299 HRCP23327 699 aa24.79■■□□□ 1.56
SELENOM-201ENST00000400299 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.78■■□□□ 1.56
SELENOM-201ENST00000400299 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
SELENOM-201ENST00000400299 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.76■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 YY1P25490 414 aa24.75■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 PTCH1Q13635 1447 aa24.75■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.75■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 TRPM2O94759 1503 aa24.74■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.71■■□□□ 1.55
SELENOM-201ENST00000400299 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SELENOM-201ENST00000400299 ABCC5O15440 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
SELENOM-201ENST00000400299 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SELENOM-201ENST00000400299 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.66■■□□□ 1.54
SELENOM-201ENST00000400299 LAMC1P11047 1609 aa24.64■■□□□ 1.54
SELENOM-201ENST00000400299 ORAI2Q96SN7 254 aa24.64■■□□□ 1.54
SELENOM-201ENST00000400299 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.64■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 GLI3P10071 1580 aa24.63■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.62■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.62■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 UNC13BO14795 1591 aa24.62■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.61■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.61■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 IFFO2Q5TF58 517 aa24.6■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 MYOM2P54296 1465 aa24.59■■□□□ 1.53
SELENOM-201ENST00000400299 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.57■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 METP08581 1390 aa24.55■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.55■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.55■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.55■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SELENOM-201ENST00000400299 DAPK1P53355 1430 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms