RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398333.7

C15orf38-AP3S2-201, Transcript of C15orf38-AP3S2 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C15orf38-AP3S2, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CD109Q6YHK3 1445 aa21.91■■□□□ 1.1
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TSPY10P0CW01 314 aa21.86■■□□□ 1.09
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 A2MP01023 1474 aa21.86■■□□□ 1.09
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.78■■□□□ 1.08
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FSD2A1L4K1 749 aa21.55■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CDCA8Q53HL2 280 aa21.55■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.54■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.54■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.54■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.53■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ATP7AQ04656 1500 aa21.53■■□□□ 1.04
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