RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
CMTM4-202ENST00000394106 HDGFP51858 240 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
CMTM4-202ENST00000394106 UBAP1LF5GYI3 381 aa45.99■■■■■ 4.95
CMTM4-202ENST00000394106 SLC26A8Q96RN1 970 aa45.99■■■■■ 4.95
CMTM4-202ENST00000394106 TRPM2O94759 1503 aa45.97■■■■■ 4.95
CMTM4-202ENST00000394106 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP45.95■■■■■ 4.95
CMTM4-202ENST00000394106 CLTCL1P53675 1640 aa45.95■■■■■ 4.95
CMTM4-202ENST00000394106 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP45.94■■■■■ 4.94
CMTM4-202ENST00000394106 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa45.93■■■■■ 4.94
CMTM4-202ENST00000394106 LRRC7Q96NW7 1537 aa45.91■■■■■ 4.94
CMTM4-202ENST00000394106 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.89■■■■■ 4.94
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
CMTM4-202ENST00000394106 FOXD1Q16676 465 aa45.82■■■■■ 4.93
CMTM4-202ENST00000394106 KIF1BO60333 1816 aa45.82■■■■■ 4.92
CMTM4-202ENST00000394106 KCNA6P17658 529 aa45.79■■■■■ 4.92
CMTM4-202ENST00000394106 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.79■■■■■ 4.92
CMTM4-202ENST00000394106 TOM1O60784 492 aa45.77■■■■■ 4.92
CMTM4-202ENST00000394106 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa45.73■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 PIP4K2BP78356 416 aa45.72■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 NWD1Q149M9 1564 aa45.71■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 TBX22Q9Y458 520 aa45.71■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa45.7■■■■■ 4.91
CMTM4-202ENST00000394106 DIP2AQ14689 1571 aa45.67■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa45.67■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 TMEM94Q12767 1356 aa45.64■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 ALKQ9UM73 1620 aa45.63■■■■■ 4.9
CMTM4-202ENST00000394106 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC144AA2RUR9 1427 aa45.6■■■■■ 4.89
CMTM4-202ENST00000394106 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa45.59■■■■■ 4.89
CMTM4-202ENST00000394106 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa45.58■■■■■ 4.89
CMTM4-202ENST00000394106 PIK3R4Q99570 1358 aa45.53■■■■■ 4.88
CMTM4-202ENST00000394106 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa45.49■■■■■ 4.87
CMTM4-202ENST00000394106 VGFO15240 615 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
CMTM4-202ENST00000394106 PPLO60437 1756 aa45.46■■■■■ 4.87
CMTM4-202ENST00000394106 PTPRUQ92729 1446 aa45.44■■■■■ 4.87
CMTM4-202ENST00000394106 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa45.44■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 HSPA1LP34931 641 aa45.43■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 RGL3Q3MIN7 710 aa45.42■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 METP08581 1390 aa45.4■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 MSH6P52701 1360 aa45.4■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa45.4■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 HRCP23327 699 aa45.38■■■■■ 4.86
CMTM4-202ENST00000394106 C14orf37Q86TY3 774 aa45.35■■■■■ 4.85
CMTM4-202ENST00000394106 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
CMTM4-202ENST00000394106 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa45.3■■■■■ 4.84
CMTM4-202ENST00000394106 IFT172Q9UG01 1749 aa45.28■■■■■ 4.84
CMTM4-202ENST00000394106 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
CMTM4-202ENST00000394106 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa45.25■■■■■ 4.83
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa45.24■■■■■ 4.83
CMTM4-202ENST00000394106 FAM135BQ49AJ0 1406 aa45.2■■■■■ 4.83
CMTM4-202ENST00000394106 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
CMTM4-202ENST00000394106 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa45.18■■■■■ 4.82
CMTM4-202ENST00000394106 C19orf44Q9H6X5 657 aa45.18■■■■■ 4.82
CMTM4-202ENST00000394106 SLAIN2Q9P270 581 aa45.18■■■■■ 4.82
CMTM4-202ENST00000394106 DISP3Q9P2K9 1392 aa45.14■■■■■ 4.82
CMTM4-202ENST00000394106 ATF3P18847 181 aa45.13■■■■■ 4.82
CMTM4-202ENST00000394106 ILDR2Q71H61 639 aa45.11■■■■■ 4.81
CMTM4-202ENST00000394106 CADPS2Q86UW7 1296 aa45.11■■■■■ 4.81
CMTM4-202ENST00000394106 PIK3C2GO75747 1445 aa45.07■■■■■ 4.81
CMTM4-202ENST00000394106 PTCH1Q13635 1447 aa45.05■■■■■ 4.8
CMTM4-202ENST00000394106 ROBO2Q9HCK4 1378 aa45.04■■■■■ 4.8
CMTM4-202ENST00000394106 DCCP43146 1447 aa45.01■■■■■ 4.8
CMTM4-202ENST00000394106 MYOM2P54296 1465 aa45.01■■■■■ 4.8
CMTM4-202ENST00000394106 NALCNQ8IZF0 1738 aa45.01■■■■■ 4.8
CMTM4-202ENST00000394106 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa45.01■■■■■ 4.8
CMTM4-202ENST00000394106 PRAG1Q86YV5 1406 aa44.98■■■■■ 4.79
CMTM4-202ENST00000394106 NRXN1Q9ULB1 1477 aa44.96■■■■■ 4.79
CMTM4-202ENST00000394106 TMEM132EQ6IEE7 984 aa44.95■■■■■ 4.79
CMTM4-202ENST00000394106 STK26Q9P289 416 aa44.95■■■■■ 4.79
CMTM4-202ENST00000394106 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa44.95■■■■■ 4.79
CMTM4-202ENST00000394106 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 PHLPP1O60346 1717 aa44.92■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 LAMC1P11047 1609 aa44.88■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 MST1RQ04912 1400 aa44.88■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 CFAP70Q5T0N1 1121 aa44.88■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa44.88■■■■■ 4.78
CMTM4-202ENST00000394106 DCAF11Q8TEB1 546 aa44.87■■■■■ 4.77
CMTM4-202ENST00000394106 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
CMTM4-202ENST00000394106 BRINP3Q76B58 766 aa44.83■■■■■ 4.77
CMTM4-202ENST00000394106 KNDC1Q76NI1 1749 aa44.83■■■■■ 4.77
CMTM4-202ENST00000394106 TECPR2O15040 1411 aa44.83■■■■■ 4.77
CMTM4-202ENST00000394106 ABCC11Q96J66 1382 aa44.82■■■■■ 4.76
CMTM4-202ENST00000394106 WAPLQ7Z5K2 1190 aa44.78■■■■■ 4.76
CMTM4-202ENST00000394106 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
CMTM4-202ENST00000394106 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
CMTM4-202ENST00000394106 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
CMTM4-202ENST00000394106 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa44.72■■■■■ 4.75
CMTM4-202ENST00000394106 SOCS7O14512 581 aa44.72■■■■■ 4.75
CMTM4-202ENST00000394106 STAC3Q96MF2 364 aa44.72■■■■■ 4.75
CMTM4-202ENST00000394106 C1orf167Q5SNV9 1468 aa44.71■■■■■ 4.75
CMTM4-202ENST00000394106 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
CMTM4-202ENST00000394106 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
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