RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.64■■■□□ 2.82
NME4-202ENST00000382940 ZFYVE9O95405 1425 aa32.62■■■□□ 2.81
NME4-202ENST00000382940 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
NME4-202ENST00000382940 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.61■■■□□ 2.81
NME4-202ENST00000382940 PIP4K2BP78356 416 aa32.6■■■□□ 2.81
NME4-202ENST00000382940 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.58■■■□□ 2.81
NME4-202ENST00000382940 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.57■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 KCNA6P17658 529 aa32.55■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32.54■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 MYO5BQ9ULV0 1848 aa32.54■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
NME4-202ENST00000382940 TRPM2O94759 1503 aa32.47■■■□□ 2.79
NME4-202ENST00000382940 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
NME4-202ENST00000382940 TBX22Q9Y458 520 aa32.45■■■□□ 2.79
NME4-202ENST00000382940 TMEM94Q12767 1356 aa32.44■■■□□ 2.78
NME4-202ENST00000382940 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
NME4-202ENST00000382940 CLTCL1P53675 1640 aa32.41■■■□□ 2.78
NME4-202ENST00000382940 HSPA1LP34931 641 aa32.39■■■□□ 2.78
NME4-202ENST00000382940 NWD1Q149M9 1564 aa32.39■■■□□ 2.78
NME4-202ENST00000382940 DIP2AQ14689 1571 aa32.37■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.37■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 ALKQ9UM73 1620 aa32.36■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.34■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 FOXD1Q16676 465 aa32.34■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.33■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.33■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 PIK3R4Q99570 1358 aa32.32■■■□□ 2.77
NME4-202ENST00000382940 MSH6P52701 1360 aa32.31■■■□□ 2.76
NME4-202ENST00000382940 C14orf37Q86TY3 774 aa32.29■■■□□ 2.76
NME4-202ENST00000382940 KIF1BO60333 1816 aa32.28■■■□□ 2.76
NME4-202ENST00000382940 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
NME4-202ENST00000382940 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.26■■■□□ 2.76
NME4-202ENST00000382940 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.26■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.25■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.25■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.24■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.22■■■□□ 2.75
NME4-202ENST00000382940 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.19■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.18■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.17■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 PTPRUQ92729 1446 aa32.17■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 METP08581 1390 aa32.16■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 RGL3Q3MIN7 710 aa32.14■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 SLAIN2Q9P270 581 aa32.14■■■□□ 2.74
NME4-202ENST00000382940 ATF3P18847 181 aa32.12■■■□□ 2.73
NME4-202ENST00000382940 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.12■■■□□ 2.73
NME4-202ENST00000382940 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.1■■■□□ 2.73
NME4-202ENST00000382940 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
NME4-202ENST00000382940 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.06■■■□□ 2.72
NME4-202ENST00000382940 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.05■■■□□ 2.72
NME4-202ENST00000382940 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.04■■■□□ 2.72
NME4-202ENST00000382940 PPLO60437 1756 aa32.02■■■□□ 2.72
NME4-202ENST00000382940 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
NME4-202ENST00000382940 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32■■■□□ 2.71
NME4-202ENST00000382940 HRCP23327 699 aa31.99■■■□□ 2.71
NME4-202ENST00000382940 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
NME4-202ENST00000382940 DCCP43146 1447 aa31.98■■■□□ 2.71
NME4-202ENST00000382940 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
NME4-202ENST00000382940 ILDR2Q71H61 639 aa31.95■■■□□ 2.71
NME4-202ENST00000382940 PTCH1Q13635 1447 aa31.94■■■□□ 2.7
NME4-202ENST00000382940 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.93■■■□□ 2.7
NME4-202ENST00000382940 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
NME4-202ENST00000382940 ROBO2Q9HCK4 1378 aa31.9■■■□□ 2.7
NME4-202ENST00000382940 PHLPP1O60346 1717 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 PIK3C2GO75747 1445 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 BRINP3Q76B58 766 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 STK26Q9P289 416 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 IFT172Q9UG01 1749 aa31.86■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.85■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 MST1RQ04912 1400 aa31.84■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 JCADQ9P266 1359 aa31.82■■■□□ 2.69
NME4-202ENST00000382940 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.81■■■□□ 2.68
NME4-202ENST00000382940 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.81■■■□□ 2.68
NME4-202ENST00000382940 MYOM2P54296 1465 aa31.8■■■□□ 2.68
NME4-202ENST00000382940 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
NME4-202ENST00000382940 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.78■■■□□ 2.68
NME4-202ENST00000382940 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
NME4-202ENST00000382940 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 ABCC11Q96J66 1382 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.75■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.74■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 TECPR2O15040 1411 aa31.74■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.73■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.72■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.72■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.72■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 SOCS7O14512 581 aa31.71■■■□□ 2.67
NME4-202ENST00000382940 LAMC1P11047 1609 aa31.68■■■□□ 2.66
NME4-202ENST00000382940 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.68■■■□□ 2.66
NME4-202ENST00000382940 STAC3Q96MF2 364 aa31.67■■■□□ 2.66
NME4-202ENST00000382940 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
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