RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.462e-46■■■■□ 22.3
NME4-202ENST00000382940 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.534e-32■■■■■ 238.3
NME4-202ENST00000382940 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.644e-27■■■■■ 42.2
NME4-202ENST00000382940 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.037e-23■■■■□ 20.4
NME4-202ENST00000382940 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.372e-18■■■■■ 196.6
NME4-202ENST00000382940 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.924e-18■■□□□ 12.5
NME4-202ENST00000382940 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.454e-18■■■■■ 190.7
NME4-202ENST00000382940 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.12e-17■■■□□ 17.4
NME4-202ENST00000382940 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.878e-17■■■■■ 69.3
NME4-202ENST00000382940 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.863e-13■■■□□ 17.3
NME4-202ENST00000382940 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.43e-12■□□□□ 10.9
NME4-202ENST00000382940 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.134e-12■□□□□ 10
NME4-202ENST00000382940 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 53.6
NME4-202ENST00000382940 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.811e-11■■□□□ 11.9
NME4-202ENST00000382940 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.141e-11■■■■■ 39.2
NME4-202ENST00000382940 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.26e-11■□□□□ 10
NME4-202ENST00000382940 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.119e-11■■■■■ 80.7
NME4-202ENST00000382940 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.21■■■□□ 2.912e-10■■■■■ 37.2
NME4-202ENST00000382940 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.623e-10■□□□□ 8.7
NME4-202ENST00000382940 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.542e-9■■■■□ 26.1
NME4-202ENST00000382940 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.193e-9■■■■■ 75.1
NME4-202ENST00000382940 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.293e-9■■■■■ 101.7
NME4-202ENST00000382940 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.263e-9■■■□□ 16.7
NME4-202ENST00000382940 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.44e-9■■■■■ 61.2
NME4-202ENST00000382940 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 129.7
NME4-202ENST00000382940 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.65e-9■■□□□ 11.9
NME4-202ENST00000382940 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.771e-8■■□□□ 13.3
NME4-202ENST00000382940 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.221e-8■□□□□ 11.3
NME4-202ENST00000382940 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.791e-8■■■□□ 18.9
NME4-202ENST00000382940 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.961e-8■□□□□ 10.9
NME4-202ENST00000382940 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.621e-8■■□□□ 14.2
NME4-202ENST00000382940 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.142e-8■■■■□ 26.5
NME4-202ENST00000382940 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.783e-8■■■□□ 18.4
NME4-202ENST00000382940 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 31.3
NME4-202ENST00000382940 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.83e-8■■□□□ 13.2
NME4-202ENST00000382940 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.683e-8■■■■■ 32.6
NME4-202ENST00000382940 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.915e-8■■■■■ 32.8
NME4-202ENST00000382940 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.085e-8■□□□□ 8.7
NME4-202ENST00000382940 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.535e-8■■■■□ 23.5
NME4-202ENST00000382940 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.975e-8■□□□□ 9.6
NME4-202ENST00000382940 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.26e-8■■■□□ 17.5
NME4-202ENST00000382940 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.061e-7■□□□□ 11.2
NME4-202ENST00000382940 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.731e-7■■■□□ 15.9
NME4-202ENST00000382940 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.48■■■■□ 3.752e-7■■■■■ 32.9
NME4-202ENST00000382940 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.592e-7■■■□□ 15.1
NME4-202ENST00000382940 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 40.5
NME4-202ENST00000382940 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 17.8
NME4-202ENST00000382940 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 24.4
NME4-202ENST00000382940 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.24e-7■■□□□ 11.5
NME4-202ENST00000382940 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.65e-7■■■■□ 25.3
NME4-202ENST00000382940 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.815e-7■■■□□ 15.7
NME4-202ENST00000382940 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 32
NME4-202ENST00000382940 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.739e-7■■■■□ 20.7
NME4-202ENST00000382940 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.319e-7■■■■□ 25
NME4-202ENST00000382940 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 23.8
NME4-202ENST00000382940 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.221e-6■■■□□ 18.6
NME4-202ENST00000382940 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 18.9
NME4-202ENST00000382940 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 11.1
NME4-202ENST00000382940 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 11.8
NME4-202ENST00000382940 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.72e-6■■■□□ 15
NME4-202ENST00000382940 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.863e-6■□□□□ 9.3
NME4-202ENST00000382940 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 20.1
NME4-202ENST00000382940 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.464e-6■■■■□ 23.1
NME4-202ENST00000382940 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 17e-6■■■■■ 27.5
NME4-202ENST00000382940 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.778e-6■■□□□ 11.6
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