RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
TPGS1-201ENST00000359315 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO41Q8TF61 875 aa40.16■■■■■ 4.02
TPGS1-201ENST00000359315 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.11■■■■■ 4.01
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.1■■■■■ 4.01
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
TPGS1-201ENST00000359315 CPS1P31327 1500 aa40.06■■■■■ 4
TPGS1-201ENST00000359315 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
TPGS1-201ENST00000359315 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
TPGS1-201ENST00000359315 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.05■■■■■ 4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
TPGS1-201ENST00000359315 BCANQ96GW7 911 aa40.04■■■■■ 4
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TPGS1-201ENST00000359315 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
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TPGS1-201ENST00000359315 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.99■■■■□ 3.99
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa39.99■■■■□ 3.99
TPGS1-201ENST00000359315 HRCP23327 699 aa39.98■■■■□ 3.99
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.95■■■■□ 3.99
TPGS1-201ENST00000359315 KIF1BO60333 1816 aa39.93■■■■□ 3.98
TPGS1-201ENST00000359315 KCNA6P17658 529 aa39.88■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.88■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 TBX22Q9Y458 520 aa39.87■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.87■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 NWD1Q149M9 1564 aa39.85■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.84■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 DIP2AQ14689 1571 aa39.82■■■■□ 3.97
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.82■■■■□ 3.96
TPGS1-201ENST00000359315 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.81■■■■□ 3.96
TPGS1-201ENST00000359315 RGL3Q3MIN7 710 aa39.81■■■■□ 3.96
TPGS1-201ENST00000359315 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
TPGS1-201ENST00000359315 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.79■■■■□ 3.96
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRUQ92729 1446 aa39.76■■■■□ 3.96
TPGS1-201ENST00000359315 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM94Q12767 1356 aa39.75■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 ALKQ9UM73 1620 aa39.73■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 METP08581 1390 aa39.72■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 PPLO60437 1756 aa39.72■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3R4Q99570 1358 aa39.71■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.69■■■■□ 3.94
TPGS1-201ENST00000359315 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
TPGS1-201ENST00000359315 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.65■■■■□ 3.94
TPGS1-201ENST00000359315 IFT172Q9UG01 1749 aa39.62■■■■□ 3.93
TPGS1-201ENST00000359315 TOM1O60784 492 aa39.62■■■■□ 3.93
TPGS1-201ENST00000359315 PIP4K2BP78356 416 aa39.61■■■■□ 3.93
TPGS1-201ENST00000359315 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
TPGS1-201ENST00000359315 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
TPGS1-201ENST00000359315 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3C2GO75747 1445 aa39.53■■■■□ 3.92
TPGS1-201ENST00000359315 MYOM2P54296 1465 aa39.49■■■■□ 3.91
TPGS1-201ENST00000359315 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.48■■■■□ 3.91
TPGS1-201ENST00000359315 MSH6P52701 1360 aa39.46■■■■□ 3.91
TPGS1-201ENST00000359315 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.45■■■■□ 3.91
TPGS1-201ENST00000359315 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
TPGS1-201ENST00000359315 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.44■■■■□ 3.9
TPGS1-201ENST00000359315 C14orf37Q86TY3 774 aa39.42■■■■□ 3.9
TPGS1-201ENST00000359315 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.41■■■■□ 3.9
TPGS1-201ENST00000359315 HSPA1LP34931 641 aa39.38■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.38■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.38■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 PTCH1Q13635 1447 aa39.38■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.38■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.37■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.36■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.33■■■■□ 3.89
TPGS1-201ENST00000359315 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.31■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 STK26Q9P289 416 aa39.31■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.29■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.28■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 SLAIN2Q9P270 581 aa39.27■■■■□ 3.88
TPGS1-201ENST00000359315 TECPR2O15040 1411 aa39.25■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.24■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 LAMC1P11047 1609 aa39.23■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 ATF3P18847 181 aa39.23■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.23■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 DCCP43146 1447 aa39.23■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC11Q96J66 1382 aa39.22■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.22■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.21■■■■□ 3.87
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRB1O14514 1584 aa39.2■■■■□ 3.87
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TPGS1-201ENST00000359315 NEUROD1Q13562 356 aa39.17■■■■□ 3.86
TPGS1-201ENST00000359315 STAC3Q96MF2 364 aa39.17■■■■□ 3.86
TPGS1-201ENST00000359315 MST1RQ04912 1400 aa39.16■■■■□ 3.86
TPGS1-201ENST00000359315 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.15■■■■□ 3.86
TPGS1-201ENST00000359315 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.13■■■■□ 3.85
TPGS1-201ENST00000359315 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.12■■■■□ 3.85
TPGS1-201ENST00000359315 BRINP3Q76B58 766 aa39.07■■■■□ 3.85
TPGS1-201ENST00000359315 SIRT1Q96EB6 747 aa39.03■■■■□ 3.84
TPGS1-201ENST00000359315 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.03■■■■□ 3.84
TPGS1-201ENST00000359315 PRAM1Q96QH2 718 aa39.02■■■■□ 3.84
TPGS1-201ENST00000359315 DLC1Q96QB1 1528 aa39.01■■■■□ 3.84
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