RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 RAPGEF3O95398 923 aa25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 CD109Q6YHK3 1445 aa25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 MSH5O43196 834 aa25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP2R1AP30153 589 aa25.85■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.84■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 PLIN1O60240 522 aa25.83■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.83■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 CDCA8Q53HL2 280 aa25.82■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.8■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.8■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.79■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 MROH2AA6NES4 1674 aa25.78■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 STAC3Q96MF2 364 aa25.78■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 NOS1P29475 1434 aa25.78■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCA6Q8N139 1617 aa25.77■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF1BO60333 1816 aa25.77■■□□□ 1.72
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.76■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.75■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 NPATQ14207 1427 aa25.74■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.74■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 PDE3BQ13370 1112 aa25.73■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.72■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 MYOM1P52179 1685 aa25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 SYNMO15061 1565 aa25.71■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 ERVK-7P63135 1459 aa25.7■■□□□ 1.71
TM7SF3-201ENST00000343028 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.7■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.69■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 MYOM2P54296 1465 aa25.67■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.65■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.65■■□□□ 1.7
TM7SF3-201ENST00000343028 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.64■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 IFT172Q9UG01 1749 aa25.62■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 SKAP1Q86WV1 359 aa25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 CRBNQ96SW2 442 aa25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGRB3O60242 1522 aa25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 APAF1O14727 1248 aa25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC3O15438 1527 aa25.57■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.57■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.56■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.56■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 STK26Q9P289 416 aa25.56■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.56■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 PIK3C2GO75747 1445 aa25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLGA2Q08379 1002 aa25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 IDI1Q13907 227 aa25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.54■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.53■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 INSRP06213 1382 aa25.52■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 PPLO60437 1756 aa25.52■■□□□ 1.68
TM7SF3-201ENST00000343028 NEUROD2Q15784 382 aa25.51■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 MORC1Q86VD1 984 aa25.51■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.51■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.5■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF521Q96K83 1311 aa25.5■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC24A1O60721 1099 aa25.5■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 CABP2Q9NPB3 220 aa25.49■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.48■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGRB1O14514 1584 aa25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 NEO1Q92859 1461 aa25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 SLFN5Q08AF3 891 aa25.45■■□□□ 1.67
TM7SF3-201ENST00000343028 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.45■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 BCAR3O75815 825 aa25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 MTHFSP49914 203 aa25.4■■□□□ 1.66
TM7SF3-201ENST00000343028 GLI2P10070 1586 aa25.39■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 RICTORQ6R327 1708 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms