RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.21■□□□□ 0.35
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ZNF548-201ENST00000336128 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.16■□□□□ 0.34
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ZNF548-201ENST00000336128 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17.08■□□□□ 0.32
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ZNF548-201ENST00000336128 ZMYM3Q14202 1370 aa16.99■□□□□ 0.31
ZNF548-201ENST00000336128 SLC24A1O60721 1099 aa16.99■□□□□ 0.31
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.99■□□□□ 0.31
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ZNF548-201ENST00000336128 TNRQ92752 1358 aa16.92■□□□□ 0.3
ZNF548-201ENST00000336128 ALKQ9UM73 1620 aa16.92■□□□□ 0.3
ZNF548-201ENST00000336128 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
ZNF548-201ENST00000336128 TMC1Q8TDI8 760 aa16.91■□□□□ 0.3
ZNF548-201ENST00000336128 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
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ZNF548-201ENST00000336128 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.89■□□□□ 0.29
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ZNF548-201ENST00000336128 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.88■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 PTPRMP28827 1452 aa16.87■□□□□ 0.29
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ZNF548-201ENST00000336128 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.86■□□□□ 0.29
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ZNF548-201ENST00000336128 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 STK26Q9P289 416 aa16.86■□□□□ 0.29
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ZNF548-201ENST00000336128 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.84■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 C3P01024 1663 aa16.84■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 EVC2Q86UK5 1308 aa16.84■□□□□ 0.29
ZNF548-201ENST00000336128 NLRP1Q9C000 1473 aa16.82■□□□□ 0.28
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ZNF548-201ENST00000336128 DLC1Q96QB1 1528 aa16.82■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
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ZNF548-201ENST00000336128 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.81■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.8■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 PRAM1Q96QH2 718 aa16.8■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 POGKQ9P215 609 aa16.79■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 PPP2R1AP30153 589 aa16.78■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.78■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.77■□□□□ 0.28
ZNF548-201ENST00000336128 USP32Q8NFA0 1604 aa16.77■□□□□ 0.27
ZNF548-201ENST00000336128 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
ZNF548-201ENST00000336128 CABP2Q9NPB3 220 aa16.76■□□□□ 0.27
ZNF548-201ENST00000336128 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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