RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.64■■□□□ 1.86
UPP1-201ENST00000331803 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.62■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.62■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.61■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 ERVK-7P63135 1459 aa26.6■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 PPLO60437 1756 aa26.59■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.59■■□□□ 1.85
UPP1-201ENST00000331803 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 CCER2I3L3R5 266 aa26.57■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 TESK2Q96S53 571 aa26.57■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 IQGAP1P46940 1657 aa26.55■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 PIK3C2GO75747 1445 aa26.53■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
UPP1-201ENST00000331803 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 ZMYM3Q14202 1370 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 TMF1P82094 1093 aa26.48■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.47■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.46■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.46■■□□□ 1.83
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE9O95405 1425 aa26.45■■□□□ 1.82
UPP1-201ENST00000331803 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
UPP1-201ENST00000331803 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.45■■□□□ 1.82
UPP1-201ENST00000331803 ADGRB1O14514 1584 aa26.39■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 SLC24A1O60721 1099 aa26.36■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 CDCA8Q53HL2 280 aa26.35■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 TNRQ92752 1358 aa26.34■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.33■■□□□ 1.81
UPP1-201ENST00000331803 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-201ENST00000331803 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
UPP1-201ENST00000331803 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.29■■□□□ 1.8
UPP1-201ENST00000331803 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
UPP1-201ENST00000331803 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
UPP1-201ENST00000331803 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
UPP1-201ENST00000331803 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 PANK3Q9H999 370 aa26.26■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 CCDC184Q52MB2 194 aa26.25■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.23■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 ALKQ9UM73 1620 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 MRS2Q9HD23 443 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 C3P01024 1663 aa26.21■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
UPP1-201ENST00000331803 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.2■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 RALBP1Q15311 655 aa26.19■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 NLRP1Q9C000 1473 aa26.19■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 STK26Q9P289 416 aa26.18■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.17■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.15■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.14■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 MYOM1P52179 1685 aa26.14■■□□□ 1.78
UPP1-201ENST00000331803 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.12■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.11■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 PTPRMP28827 1452 aa26.11■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.09■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 EVC2Q86UK5 1308 aa26.09■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.08■■□□□ 1.77
UPP1-201ENST00000331803 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 PRAM1Q96QH2 718 aa26.08■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 POGKQ9P215 609 aa26.06■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 TMC1Q8TDI8 760 aa26.06■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.04■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 BCANQ96GW7 911 aa26.04■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 LTKP29376 864 aa26.02■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 METP08581 1390 aa26.02■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 NLRP13Q86W25 1043 aa26.02■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 ABCC11Q96J66 1382 aa26.02■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 DLC1Q96QB1 1528 aa26.02■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
UPP1-201ENST00000331803 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.01■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 EID1Q9Y6B2 187 aa26■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.99■■□□□ 1.75
UPP1-201ENST00000331803 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms