RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PPLO60437 1756 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 AGLP35573 1532 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 CCDC184Q52MB2 194 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.64■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 TMF1P82094 1093 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 IDI1Q13907 227 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-201ENST00000331789 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 MLECQ14165 292 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 PIK3C2GO75747 1445 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 MRS2Q9HD23 443 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ACTB-201ENST00000331789 ERVK-7P63135 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 PANK3Q9H999 370 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-201ENST00000331789 ADGRB1O14514 1584 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 CDCA8Q53HL2 280 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 RALBP1Q15311 655 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 ZFYVE9O95405 1425 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-201ENST00000331789 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 MYOM1P52179 1685 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 ZMYM3Q14202 1370 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 SLC24A1O60721 1099 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 TMC1Q8TDI8 760 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-201ENST00000331789 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-201ENST00000331789 STK26Q9P289 416 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-201ENST00000331789 NLRP13Q86W25 1043 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-201ENST00000331789 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-201ENST00000331789 ALKQ9UM73 1620 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-201ENST00000331789 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ACTB-201ENST00000331789 TNRQ92752 1358 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-201ENST00000331789 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 PTPRMP28827 1452 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 EVC2Q86UK5 1308 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.14■■□□□ 1.46
ACTB-201ENST00000331789 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 PRAM1Q96QH2 718 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 PPP2R1AP30153 589 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.453e-11■■■■□ 24.1
ACTB-201ENST00000331789 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 C3P01024 1663 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 CABP2Q9NPB3 220 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 POGKQ9P215 609 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-201ENST00000331789 FKBP8Q14318 412 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.05■■□□□ 1.44
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