RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MED14O60244 1454 aa39.14■■■■□ 3.86
CRIP1-201ENST00000330233 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.14■■■■□ 3.86
CRIP1-201ENST00000330233 ZFYVE9O95405 1425 aa39.12■■■■□ 3.85
CRIP1-201ENST00000330233 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
CRIP1-201ENST00000330233 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.11■■■■□ 3.85
CRIP1-201ENST00000330233 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.09■■■■□ 3.85
CRIP1-201ENST00000330233 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
CRIP1-201ENST00000330233 IQGAP1P46940 1657 aa39.05■■■■□ 3.84
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.05■■■■□ 3.84
CRIP1-201ENST00000330233 RGL3Q3MIN7 710 aa39.03■■■■□ 3.84
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
CRIP1-201ENST00000330233 VGFO15240 615 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
CRIP1-201ENST00000330233 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa38.98■■■■□ 3.83
CRIP1-201ENST00000330233 BCANQ96GW7 911 aa38.97■■■■□ 3.83
CRIP1-201ENST00000330233 PPLO60437 1756 aa38.96■■■■□ 3.83
CRIP1-201ENST00000330233 IFT172Q9UG01 1749 aa38.87■■■■□ 3.81
CRIP1-201ENST00000330233 SLC26A8Q96RN1 970 aa38.86■■■■□ 3.81
CRIP1-201ENST00000330233 STAC3Q96MF2 364 aa38.84■■■■□ 3.81
CRIP1-201ENST00000330233 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.84■■■■□ 3.81
CRIP1-201ENST00000330233 TBX22Q9Y458 520 aa38.84■■■■□ 3.81
CRIP1-201ENST00000330233 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
CRIP1-201ENST00000330233 NEUROD1Q13562 356 aa38.8■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa38.79■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 DIP2AQ14689 1571 aa38.77■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa38.77■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.77■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa38.76■■■■□ 3.8
CRIP1-201ENST00000330233 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa38.73■■■■□ 3.79
CRIP1-201ENST00000330233 MYOM2P54296 1465 aa38.73■■■■□ 3.79
CRIP1-201ENST00000330233 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.72■■■■□ 3.79
CRIP1-201ENST00000330233 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa38.71■■■■□ 3.79
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3R4Q99570 1358 aa38.69■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA6P17658 529 aa38.68■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.68■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 NRXN1Q9ULB1 1477 aa38.65■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 ALKQ9UM73 1620 aa38.65■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3C2GO75747 1445 aa38.64■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 CPS1P31327 1500 aa38.63■■■■□ 3.78
CRIP1-201ENST00000330233 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.63■■■■□ 3.77
CRIP1-201ENST00000330233 L3MBTL2Q969R5 705 aa38.63■■■■□ 3.77
CRIP1-201ENST00000330233 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CRIP1-201ENST00000330233 METP08581 1390 aa38.58■■■■□ 3.77
CRIP1-201ENST00000330233 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CRIP1-201ENST00000330233 CERKQ8TCT0 537 aa38.57■■■■□ 3.76
CRIP1-201ENST00000330233 NWD1Q149M9 1564 aa38.55■■■■□ 3.76
CRIP1-201ENST00000330233 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa38.55■■■■□ 3.76
CRIP1-201ENST00000330233 TONSLQ96HA7 1378 aa38.55■■■■□ 3.76
CRIP1-201ENST00000330233 LAMC1P11047 1609 aa38.54■■■■□ 3.76
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP70Q5T0N1 1121 aa38.51■■■■□ 3.76
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRUQ92729 1446 aa38.5■■■■□ 3.75
CRIP1-201ENST00000330233 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CRIP1-201ENST00000330233 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC7Q96NW7 1537 aa38.46■■■■□ 3.75
CRIP1-201ENST00000330233 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.45■■■■□ 3.75
CRIP1-201ENST00000330233 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.45■■■■□ 3.75
CRIP1-201ENST00000330233 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CRIP1-201ENST00000330233 PRAG1Q86YV5 1406 aa38.43■■■■□ 3.74
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM132EQ6IEE7 984 aa38.42■■■■□ 3.74
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa38.41■■■■□ 3.74
CRIP1-201ENST00000330233 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM94Q12767 1356 aa38.36■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa38.36■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa38.35■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC11Q96J66 1382 aa38.35■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 STK26Q9P289 416 aa38.35■■■■□ 3.73
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRB1O14514 1584 aa38.31■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 PTCH1Q13635 1447 aa38.3■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 KNDC1Q76NI1 1749 aa38.29■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 SIRT1Q96EB6 747 aa38.29■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 TECPR2O15040 1411 aa38.29■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 ROBO2Q9HCK4 1378 aa38.26■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 C14orf37Q86TY3 774 aa38.26■■■■□ 3.72
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF1Q3BBV0 1214 aa38.25■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.25■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa38.24■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 C19orf44Q9H6X5 657 aa38.22■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 MSH6P52701 1360 aa38.22■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 TOM1O60784 492 aa38.2■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 TRAK1Q9UPV9 953 aa38.2■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 FAM135BQ49AJ0 1406 aa38.2■■■■□ 3.71
CRIP1-201ENST00000330233 DLC1Q96QB1 1528 aa38.18■■■■□ 3.7
CRIP1-201ENST00000330233 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.16■■■■□ 3.7
CRIP1-201ENST00000330233 WAPLQ7Z5K2 1190 aa38.16■■■■□ 3.7
CRIP1-201ENST00000330233 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO41Q8TF61 875 aa38.14■■■■□ 3.7
CRIP1-201ENST00000330233 POGKQ9P215 609 aa38.13■■■■□ 3.7
CRIP1-201ENST00000330233 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 PRAM1Q96QH2 718 aa38.12■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa38.11■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 ATF3P18847 181 aa38.11■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 CADPS2Q86UW7 1296 aa38.11■■■■□ 3.69
CRIP1-201ENST00000330233 RALGAPBQ86X10 1494 aa38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms