RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330070.5

HOXB2-201, Transcript of homeobox B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB2, Length 1,562 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-201ENST00000330070 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB2-201ENST00000330070 CLTCL1P53675 1640 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB2-201ENST00000330070 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB2-201ENST00000330070 CPS1P31327 1500 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB2-201ENST00000330070 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB2-201ENST00000330070 KIF1BO60333 1816 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB2-201ENST00000330070 FBXO41Q8TF61 875 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB2-201ENST00000330070 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXB2-201ENST00000330070 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXB2-201ENST00000330070 FOXD1Q16676 465 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXB2-201ENST00000330070 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXB2-201ENST00000330070 DIP2AQ14689 1571 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 BCANQ96GW7 911 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 TBX22Q9Y458 520 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXB2-201ENST00000330070 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 KCNA6P17658 529 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 PIK3R4Q99570 1358 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 NWD1Q149M9 1564 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXB2-201ENST00000330070 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
HOXB2-201ENST00000330070 PPLO60437 1756 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB2-201ENST00000330070 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB2-201ENST00000330070 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXB2-201ENST00000330070 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXB2-201ENST00000330070 IFT172Q9UG01 1749 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXB2-201ENST00000330070 RGL3Q3MIN7 710 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXB2-201ENST00000330070 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB2-201ENST00000330070 TOM1O60784 492 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB2-201ENST00000330070 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 TMEM94Q12767 1356 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 MYOM2P54296 1465 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 ALKQ9UM73 1620 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 PTPRUQ92729 1446 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 METP08581 1390 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXB2-201ENST00000330070 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 STAC3Q96MF2 364 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 PIK3C2GO75747 1445 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 MSH6P52701 1360 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXB2-201ENST00000330070 PTCH1Q13635 1447 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXB2-201ENST00000330070 LAMC1P11047 1609 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB2-201ENST00000330070 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 PIP4K2BP78356 416 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 C14orf37Q86TY3 774 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 DCCP43146 1447 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 TECPR2O15040 1411 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXB2-201ENST00000330070 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 ABCC11Q96J66 1382 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 ATF3P18847 181 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXB2-201ENST00000330070 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 SLAIN2Q9P270 581 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 SIRT1Q96EB6 747 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 ADGRB1O14514 1584 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 HSPA1LP34931 641 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXB2-201ENST00000330070 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.89■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 STK26Q9P289 416 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 DLC1Q96QB1 1528 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 MST1RQ04912 1400 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXB2-201ENST00000330070 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXB2-201ENST00000330070 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXB2-201ENST00000330070 NEUROD1Q13562 356 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXB2-201ENST00000330070 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXB2-201ENST00000330070 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.76■■■□□ 2.2
HOXB2-201ENST00000330070 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms