RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.91■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 SLIT1O75093 1534 aa25.89■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.89■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.89■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 LTKP29376 864 aa25.88■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 CPS1P31327 1500 aa25.88■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.86■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 KIF1BO60333 1816 aa25.85■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 EID1Q9Y6B2 187 aa25.85■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.85■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.84■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.83■■□□□ 1.73
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRB3O60242 1522 aa25.82■■□□□ 1.72
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.78■■□□□ 1.72
SYNE4-201ENST00000324444 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.76■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.76■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.76■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 STAC3Q96MF2 364 aa25.75■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 IFT172Q9UG01 1749 aa25.74■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.71■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 TOM1O60784 492 aa25.7■■□□□ 1.71
SYNE4-201ENST00000324444 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 PIP4K2BP78356 416 aa25.69■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 PPLO60437 1756 aa25.68■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.67■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.65■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 ZFYVE9O95405 1425 aa25.65■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 BCANQ96GW7 911 aa25.65■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.64■■□□□ 1.7
SYNE4-201ENST00000324444 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 MYOM2P54296 1465 aa25.63■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 RGL3Q3MIN7 710 aa25.61■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.61■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.6■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 ALKQ9UM73 1620 aa25.6■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 KCNA6P17658 529 aa25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA1LP34931 641 aa25.57■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.56■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.55■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM94Q12767 1356 aa25.53■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.52■■□□□ 1.68
SYNE4-201ENST00000324444 NWD1Q149M9 1564 aa25.51■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.5■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.49■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 PIK3C2GO75747 1445 aa25.49■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.48■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 TBX22Q9Y458 520 aa25.48■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.47■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.46■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 DIP2AQ14689 1571 aa25.45■■□□□ 1.67
SYNE4-201ENST00000324444 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 LAMC1P11047 1609 aa25.44■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.44■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.42■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-201ENST00000324444 PIK3R4Q99570 1358 aa25.38■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 MSH6P52701 1360 aa25.37■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.37■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 ILDR2Q71H61 639 aa25.37■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.36■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.35■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRB1O14514 1584 aa25.34■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.34■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.33■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRUQ92729 1446 aa25.33■■□□□ 1.65
SYNE4-201ENST00000324444 C14orf37Q86TY3 774 aa25.32■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.3■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.29■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 METP08581 1390 aa25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 SLAIN2Q9P270 581 aa25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 USP47Q96K76 1375 aa25.27■■□□□ 1.64
SYNE4-201ENST00000324444 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYNE4-201ENST00000324444 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.24■■□□□ 1.63
SYNE4-201ENST00000324444 SLC24A1O60721 1099 aa25.23■■□□□ 1.63
SYNE4-201ENST00000324444 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SYNE4-201ENST00000324444 ATF3P18847 181 aa25.21■■□□□ 1.63
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