RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
HOXD8-201ENST00000313173 PPLO60437 1756 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXD8-201ENST00000313173 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
HOXD8-201ENST00000313173 TESK2Q96S53 571 aa37.01■■■■□ 3.52
HOXD8-201ENST00000313173 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.99■■■■□ 3.51
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.98■■■■□ 3.51
HOXD8-201ENST00000313173 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
HOXD8-201ENST00000313173 MLECQ14165 292 aa36.97■■■■□ 3.51
HOXD8-201ENST00000313173 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.96■■■■□ 3.51
HOXD8-201ENST00000313173 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.95■■■■□ 3.51
HOXD8-201ENST00000313173 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.92■■■■□ 3.5
HOXD8-201ENST00000313173 TMF1P82094 1093 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD8-201ENST00000313173 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD8-201ENST00000313173 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 PIK3C2GO75747 1445 aa36.87■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.87■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 ERVK-7P63135 1459 aa36.84■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.84■■■■□ 3.49
HOXD8-201ENST00000313173 IDI1Q13907 227 aa36.82■■■■□ 3.48
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC184Q52MB2 194 aa36.77■■■■□ 3.48
HOXD8-201ENST00000313173 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.76■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 MRS2Q9HD23 443 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 ZFYVE9O95405 1425 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRB1O14514 1584 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 CDCA8Q53HL2 280 aa36.7■■■■□ 3.47
HOXD8-201ENST00000313173 SLC24A1O60721 1099 aa36.67■■■■□ 3.46
HOXD8-201ENST00000313173 ZMYM3Q14202 1370 aa36.65■■■■□ 3.46
HOXD8-201ENST00000313173 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.46
HOXD8-201ENST00000313173 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 RALBP1Q15311 655 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 PANK3Q9H999 370 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 MYOM1P52179 1685 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
HOXD8-201ENST00000313173 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.55■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.54■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 FAM9BQ8IZU0 186 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.51■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.51■■■■□ 3.44
HOXD8-201ENST00000313173 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.51■■■■□ 3.43
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
HOXD8-201ENST00000313173 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.49■■■■□ 3.43
HOXD8-201ENST00000313173 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
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HOXD8-201ENST00000313173 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD8-201ENST00000313173 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
HOXD8-201ENST00000313173 TMC1Q8TDI8 760 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXD8-201ENST00000313173 NLRP13Q86W25 1043 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXD8-201ENST00000313173 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.39■■■■□ 3.42
HOXD8-201ENST00000313173 TNRQ92752 1358 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 ALKQ9UM73 1620 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 C3P01024 1663 aa36.37■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXD8-201ENST00000313173 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRMP28827 1452 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
HOXD8-201ENST00000313173 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 EVC2Q86UK5 1308 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 STK26Q9P289 416 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXD8-201ENST00000313173 NLRP1Q9C000 1473 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXD8-201ENST00000313173 DLC1Q96QB1 1528 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXD8-201ENST00000313173 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXD8-201ENST00000313173 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 PPP2R1AP30153 589 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 PRAM1Q96QH2 718 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 INSRP06213 1382 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.37
HOXD8-201ENST00000313173 USP32Q8NFA0 1604 aa36.1■■■■□ 3.37
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