RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.06■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE3AQ14432 1141 aa29.04■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCAR3O75815 825 aa29.04■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PANK2Q9BZ23 570 aa29.04■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MCM4P33991 863 aa29.03■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.03■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.03■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.03■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.02■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A2MP01023 1474 aa29.02■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSPY4P0CV99 314 aa29.02■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSPY10P0CW01 314 aa29.02■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.01■■■□□ 2.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.01■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRE11P49959 708 aa29.01■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.01■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 E9PSI1 815 aa28.99■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIK3C2GO75747 1445 aa28.99■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.98■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGL3Q3MIN7 710 aa28.98■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC2Q92887 1545 aa28.98■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.98■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUP160Q12769 1436 aa28.97■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARXQ96QS3 562 aa28.95■■■□□ 2.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLXNC1O60486 1568 aa28.95■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.93■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NGEFQ8N5V2 710 aa28.92■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAK2O60296 914 aa28.91■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.91■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ESPNB1AK53 854 aa28.91■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AAMPQ13685 434 aa28.91■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.91■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APAF1O14727 1248 aa28.9■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.9■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYNJ2O15056 1496 aa28.9■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.9■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.89■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLA2R1Q13018 1463 aa28.89■■■□□ 2.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.89■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.88■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.88■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COG6Q9Y2V7 657 aa28.88■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.88■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.86■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYNMO15061 1565 aa28.86■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PANK1Q8TE04 598 aa28.86■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPM2P07951 284 aa28.85■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERBB4Q15303 1308 aa28.85■■■□□ 2.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDCA8Q53HL2 280 aa28.82■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.81■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.81■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.8■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.8■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.79■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.78■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNC13BO14795 1591 aa28.78■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.77■■■□□ 2.2
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.75■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQGAP1P46940 1657 aa28.74■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GRIN2AQ12879 1464 aa28.73■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.72■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.72■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP10AO60312 1499 aa28.72■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.7■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WWC1Q8IX03 1113 aa28.7■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYOM1P52179 1685 aa28.69■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.68■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDIT3P35638 169 aa28.68■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCA8O94911 1581 aa28.67■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.66■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSCBQ8IWL3 235 aa28.65■■■□□ 2.18
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.64■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RLBP1P12271 317 aa28.63■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GAS2L3Q86XJ1 694 aa28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.174e-7■■■■□ 19.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP10BO94823 1461 aa28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MADDQ8WXG6 1647 aa28.62■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.59■■■□□ 2.17
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms