RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 OSCARQ8IYS5 282 aa26.86■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.86■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.86■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.85■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.83■■□□□ 1.89
HPS6-201ENST00000299238 NLRP13Q86W25 1043 aa26.83■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.82■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 TMF1P82094 1093 aa26.82■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.8■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 STAC3Q96MF2 364 aa26.78■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.78■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.78■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 KIF1BO60333 1816 aa26.78■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 NEFMP07197 916 aa26.78■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 CD109Q6YHK3 1445 aa26.77■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HPS6-201ENST00000299238 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.76■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.75■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 PANK3Q9H999 370 aa26.74■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 IFT172Q9UG01 1749 aa26.74■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 MROH2AA6NES4 1674 aa26.73■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.73■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.73■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.72■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 MYOM2P54296 1465 aa26.72■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 ABCA6Q8N139 1617 aa26.72■■□□□ 1.87
HPS6-201ENST00000299238 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.69■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 SYNMO15061 1565 aa26.68■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.66■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 INSRP06213 1382 aa26.66■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 MYOM1P52179 1685 aa26.65■■□□□ 1.86
HPS6-201ENST00000299238 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 ADGRB3O60242 1522 aa26.63■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 PDE3BQ13370 1112 aa26.62■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 CDCA8Q53HL2 280 aa26.6■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.6■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.59■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 NPATQ14207 1427 aa26.59■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 NEO1Q92859 1461 aa26.59■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.59■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.58■■□□□ 1.85
HPS6-201ENST00000299238 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.57■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 USP35Q9P2H5 1018 aa26.57■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 ABCC3O15438 1527 aa26.56■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 PPLO60437 1756 aa26.55■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 GGT6Q6P531 493 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 NOS1P29475 1434 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.53■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.52■■□□□ 1.84
HPS6-201ENST00000299238 ERVK-7P63135 1459 aa26.51■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 RICTORQ6R327 1708 aa26.51■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.5■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.49■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 RAPGEF3O95398 923 aa26.49■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 GSE1Q14687 1217 aa26.48■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 PPP2R1AP30153 589 aa26.47■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 PLIN1O60240 522 aa26.46■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 PIK3C2GO75747 1445 aa26.45■■□□□ 1.83
HPS6-201ENST00000299238 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.44■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 SLC24A1O60721 1099 aa26.43■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 PIK3C2BO00750 1634 aa26.43■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.43■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.43■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.42■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 ADGRB1O14514 1584 aa26.4■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.4■■□□□ 1.82
HPS6-201ENST00000299238 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 ZMYND15Q9H091 742 aa26.37■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHG5O94827 1062 aa26.37■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.36■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 GLI2P10070 1586 aa26.36■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.35■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.35■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.35■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.33■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.33■■□□□ 1.81
HPS6-201ENST00000299238 ZNF521Q96K83 1311 aa26.32■■□□□ 1.8
HPS6-201ENST00000299238 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.32■■□□□ 1.8
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