RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289388.3

CATIP-201, Transcript of ciliogenesis associated TTC17 interacting protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CATIP, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATIP-201ENST00000289388 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.95■■■■■ 4.15
CATIP-201ENST00000289388 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.15
CATIP-201ENST00000289388 IQGAP1P46940 1657 aa40.93■■■■■ 4.14
CATIP-201ENST00000289388 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.91■■■■■ 4.14
CATIP-201ENST00000289388 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CATIP-201ENST00000289388 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.83■■■■■ 4.13
CATIP-201ENST00000289388 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.81■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.8■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.78■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.71■■■■■ 4.11
CATIP-201ENST00000289388 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
CATIP-201ENST00000289388 PPLO60437 1756 aa40.68■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.66■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 BCANQ96GW7 911 aa40.66■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 RGL3Q3MIN7 710 aa40.65■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 TBX22Q9Y458 520 aa40.64■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 DIP2AQ14689 1571 aa40.63■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.62■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 IFT172Q9UG01 1749 aa40.62■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.61■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.59■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 CPS1P31327 1500 aa40.58■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.55■■■■■ 4.08
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CATIP-201ENST00000289388 CERKQ8TCT0 537 aa40.53■■■■■ 4.08
CATIP-201ENST00000289388 STAC3Q96MF2 364 aa40.52■■■■■ 4.08
CATIP-201ENST00000289388 KCNA6P17658 529 aa40.5■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.49■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.48■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 MYOM2P54296 1465 aa40.47■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 NWD1Q149M9 1564 aa40.45■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.45■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.42■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 ALKQ9UM73 1620 aa40.4■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 PIK3C2GO75747 1445 aa40.4■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
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CATIP-201ENST00000289388 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.36■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.35■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.35■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 METP08581 1390 aa40.34■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 PTPRUQ92729 1446 aa40.3■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.29■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 LAMC1P11047 1609 aa40.28■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 NEUROD1Q13562 356 aa40.26■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.26■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.26■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.22■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.22■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
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CATIP-201ENST00000289388 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.19■■■■■ 4.02
CATIP-201ENST00000289388 FBXO41Q8TF61 875 aa40.17■■■■■ 4.02
CATIP-201ENST00000289388 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.16■■■■■ 4.02
CATIP-201ENST00000289388 PTCH1Q13635 1447 aa40.13■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.13■■■■■ 4.01
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CATIP-201ENST00000289388 TECPR2O15040 1411 aa40.1■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.09■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.08■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 TONSLQ96HA7 1378 aa40.07■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.07■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
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CATIP-201ENST00000289388 ADGRB1O14514 1584 aa40.05■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 MSH6P52701 1360 aa40.04■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.03■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 SIRT1Q96EB6 747 aa40.03■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.02■■■■■ 4
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CATIP-201ENST00000289388 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.99■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 STK26Q9P289 416 aa39.98■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.97■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 C14orf37Q86TY3 774 aa39.96■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.96■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 DLC1Q96QB1 1528 aa39.94■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 DCCP43146 1447 aa39.94■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.93■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.9■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.87■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.86■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 ATF3P18847 181 aa39.86■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.84■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.83■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.82■■■■□ 3.96
CATIP-201ENST00000289388 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.82■■■■□ 3.96
CATIP-201ENST00000289388 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.79■■■■□ 3.96
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