RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.06■■■■□ 3.36
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PPP4C-201ENST00000279387 BCANQ96GW7 911 aa36■■■■□ 3.35
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PPP4C-201ENST00000279387 KIF1BO60333 1816 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP4C-201ENST00000279387 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
PPP4C-201ENST00000279387 FBXO41Q8TF61 875 aa35.97■■■■□ 3.35
PPP4C-201ENST00000279387 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PPP4C-201ENST00000279387 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP4C-201ENST00000279387 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
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PPP4C-201ENST00000279387 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP4C-201ENST00000279387 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP4C-201ENST00000279387 HRCP23327 699 aa35.74■■■■□ 3.31
PPP4C-201ENST00000279387 RGL3Q3MIN7 710 aa35.74■■■■□ 3.31
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PPP4C-201ENST00000279387 KCNA6P17658 529 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP4C-201ENST00000279387 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
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PPP4C-201ENST00000279387 NWD1Q149M9 1564 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP4C-201ENST00000279387 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP4C-201ENST00000279387 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.63■■■■□ 3.29
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PPP4C-201ENST00000279387 TMEM94Q12767 1356 aa35.6■■■■□ 3.29
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PPP4C-201ENST00000279387 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.54■■■■□ 3.28
PPP4C-201ENST00000279387 TOM1O60784 492 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP4C-201ENST00000279387 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
PPP4C-201ENST00000279387 PIK3R4Q99570 1358 aa35.52■■■■□ 3.28
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PPP4C-201ENST00000279387 C14orf37Q86TY3 774 aa35.42■■■■□ 3.26
PPP4C-201ENST00000279387 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.38■■■■□ 3.25
PPP4C-201ENST00000279387 MSH6P52701 1360 aa35.37■■■■□ 3.25
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PPP4C-201ENST00000279387 MYOM2P54296 1465 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP4C-201ENST00000279387 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP4C-201ENST00000279387 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP4C-201ENST00000279387 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
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PPP4C-201ENST00000279387 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP4C-201ENST00000279387 HSPA1LP34931 641 aa35.3■■■■□ 3.24
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PPP4C-201ENST00000279387 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP4C-201ENST00000279387 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP4C-201ENST00000279387 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.26■■■■□ 3.24
PPP4C-201ENST00000279387 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.26■■■■□ 3.24
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PPP4C-201ENST00000279387 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.23■■■■□ 3.23
PPP4C-201ENST00000279387 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PPP4C-201ENST00000279387 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP4C-201ENST00000279387 PTCH1Q13635 1447 aa35.22■■■■□ 3.23
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PPP4C-201ENST00000279387 ATF3P18847 181 aa35.2■■■■□ 3.23
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PPP4C-201ENST00000279387 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.16■■■■□ 3.22
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PPP4C-201ENST00000279387 ADGRB1O14514 1584 aa35.07■■■■□ 3.2
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PPP4C-201ENST00000279387 MST1RQ04912 1400 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP4C-201ENST00000279387 STAC3Q96MF2 364 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP4C-201ENST00000279387 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
PPP4C-201ENST00000279387 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.02■■■■□ 3.2
PPP4C-201ENST00000279387 PHLPP1O60346 1717 aa35.01■■■■□ 3.2
PPP4C-201ENST00000279387 BRINP3Q76B58 766 aa34.98■■■■□ 3.19
PPP4C-201ENST00000279387 PRAM1Q96QH2 718 aa34.98■■■■□ 3.19
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