RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 ZFYVE9O95405 1425 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 LTKP29376 864 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 RGL3Q3MIN7 710 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 MED14O60244 1454 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 IQGAP1P46940 1657 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 NEUROD1Q13562 356 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 PPLO60437 1756 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD11-201ENST00000249504 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
HOXD11-201ENST00000249504 BCANQ96GW7 911 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD11-201ENST00000249504 IFT172Q9UG01 1749 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD11-201ENST00000249504 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXD11-201ENST00000249504 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXD11-201ENST00000249504 TONSLQ96HA7 1378 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD11-201ENST00000249504 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD11-201ENST00000249504 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.08■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 DIP2AQ14689 1571 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 MYOM2P54296 1465 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD11-201ENST00000249504 TBX22Q9Y458 520 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HOXD11-201ENST00000249504 STAC3Q96MF2 364 aa28■■■□□ 2.07
HOXD11-201ENST00000249504 PIK3C2GO75747 1445 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXD11-201ENST00000249504 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXD11-201ENST00000249504 ALKQ9UM73 1620 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXD11-201ENST00000249504 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 PIK3R4Q99570 1358 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 LAMC1P11047 1609 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 NWD1Q149M9 1564 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 CPS1P31327 1500 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 KCNA6P17658 529 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 METP08581 1390 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXD11-201ENST00000249504 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRUQ92729 1446 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 CERKQ8TCT0 537 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD11-201ENST00000249504 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRB1O14514 1584 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 STK26Q9P289 416 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM94Q12767 1356 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 PTCH1Q13635 1447 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC11Q96J66 1382 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 TECPR2O15040 1411 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 C14orf37Q86TY3 774 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 DLC1Q96QB1 1528 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD11-201ENST00000249504 MSH6P52701 1360 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 SIRT1Q96EB6 747 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD11-201ENST00000249504 PRAM1Q96QH2 718 aa27.57■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 POGKQ9P215 609 aa27.57■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms