RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.75■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 AGLP35573 1532 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC184Q52MB2 194 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-201ENST00000216840 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-201ENST00000216840 TMF1P82094 1093 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-201ENST00000216840 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-201ENST00000216840 MRS2Q9HD23 443 aa23.64■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 PIK3C2GO75747 1445 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 IDI1Q13907 227 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RABGGTA-201ENST00000216840 ERVK-7P63135 1459 aa23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRB1O14514 1584 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 RALBP1Q15311 655 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 CDCA8Q53HL2 280 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 PANK3Q9H999 370 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 ZFYVE9O95405 1425 aa23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 MYOM1P52179 1685 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 MLECQ14165 292 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC24A1O60721 1099 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.45■■□□□ 1.35
RABGGTA-201ENST00000216840 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 TMC1Q8TDI8 760 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-201ENST00000216840 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 ZMYM3Q14202 1370 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP13Q86W25 1043 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
RABGGTA-201ENST00000216840 ALKQ9UM73 1620 aa23.32■■□□□ 1.32
RABGGTA-201ENST00000216840 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.3■■□□□ 1.32
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.3■■□□□ 1.32
RABGGTA-201ENST00000216840 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
RABGGTA-201ENST00000216840 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-201ENST00000216840 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 TNRQ92752 1358 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRMP28827 1452 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 STK26Q9P289 416 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 EVC2Q86UK5 1308 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP2R1AP30153 589 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 FKBP8Q14318 412 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.2■■□□□ 1.31
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 NEFLP07196 543 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 INSRP06213 1382 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 PRAM1Q96QH2 718 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 C3P01024 1663 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 DLC1Q96QB1 1528 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 USP32Q8NFA0 1604 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 POGKQ9P215 609 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-201ENST00000216840 CABP2Q9NPB3 220 aa23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-201ENST00000216840 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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