RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa30.77■■■□□ 2.52
Opn3-201ENSMUST00000027809 Stk24Q99KH8 431 aa30.77■■■□□ 2.52
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa30.74■■■□□ 2.51
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hfm1D3Z4R1 1434 aa30.73■■■□□ 2.51
Opn3-201ENSMUST00000027809 Setd1aE9PYH6 1716 aa30.72■■■□□ 2.51
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mroh1E0CZ22 1640 aa30.71■■■□□ 2.51
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plekhg5Q66T02 1073 aa30.71■■■□□ 2.51
Opn3-201ENSMUST00000027809 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa30.7■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Skint5A7XUY5 1461 aa30.69■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 RictorQ6QI06 1708 aa30.68■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa30.67■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Afap1Q80YS6 731 aa30.67■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Myo3aQ8K3H5 1613 aa30.65■■■□□ 2.5
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa30.64■■■□□ 2.49
Opn3-201ENSMUST00000027809 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dnajc5gQ8C632 165 aa30.61■■■□□ 2.49
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pola1P33609 1465 aa30.61■■■□□ 2.49
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa30.57■■■□□ 2.48
Opn3-201ENSMUST00000027809 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kdm2aP59997 1161 aa30.55■■■□□ 2.48
Opn3-201ENSMUST00000027809 AU022751B1B0V2 589 aa30.51■■■□□ 2.48
Opn3-201ENSMUST00000027809 DnmbpQ6TXD4 1580 aa30.51■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 PtprmP28828 1452 aa30.5■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa30.5■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm20521D3Z5F7 333 aa30.49■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nphp4P59240 1425 aa30.49■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa30.48■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Stard8Q8K031 1019 aa30.47■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa30.47■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kif13aQ9EQW7 1749 aa30.47■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Srcin1Q9QWI6 1250 aa30.47■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Os9Q8K2C7 672 aa30.45■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa30.45■■■□□ 2.47
Opn3-201ENSMUST00000027809 Naip7Q9JIB3 1402 aa30.43■■■□□ 2.46
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fan1Q69ZT1 1020 aa30.42■■■□□ 2.46
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm13695A2AK44 830 aa30.4■■■□□ 2.46
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc52a2Q9D8F3 450 aa30.4■■■□□ 2.46
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa30.39■■■□□ 2.46
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sbno1Q689Z5 1390 aa30.39■■■□□ 2.46
Opn3-201ENSMUST00000027809 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lrrc7Q80TE7 1490 aa30.38■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Usp40Q8BWR4 1235 aa30.36■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa30.36■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zbtb4Q5F293 982 aa30.35■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa30.35■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 PalldQ9ET54 1408 aa30.34■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ift172Q6VH22 1749 aa30.33■■■□□ 2.45
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgef28P97433 1693 aa30.3■■■□□ 2.44
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
Opn3-201ENSMUST00000027809 MaddQ80U28 1577 aa30.28■■■□□ 2.44
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 PrxO55103 1391 aa30.25■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa30.25■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plppr3Q7TPB0 716 aa30.24■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc24a1Q91WD8 1130 aa30.24■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dip2bQ3UH60 1574 aa30.23■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 PplQ9R269 1755 aa30.2■■■□□ 2.43
Opn3-201ENSMUST00000027809 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa30.16■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Stra8P70278 393 aa30.16■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Shq1Q7TMX5 569 aa30.16■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pank3Q8R2W9 370 aa30.16■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Exoc6Q8R313 802 aa30.16■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dip2aQ8BWT5 1523 aa30.15■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmf1B9EKI3 1091 aa30.15■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 IqubQ8CDK3 788 aa30.14■■■□□ 2.42
Opn3-201ENSMUST00000027809 Stag3O70576 1240 aa30.11■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mrs2Q5NCE8 434 aa30.1■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa30.1■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc4a1apE9PX68 744 aa30.1■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 InsrP15208 1372 aa30.09■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atp1b4Q99ME6 356 aa30.09■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam184bQ0KK56 942 aa30.08■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zscan10Q3URR7 782 aa30.08■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Plekhg1F6S200 1446 aa30.08■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Inpp5dQ9ES52 1191 aa30.08■■■□□ 2.41
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cep170bQ80U49 1574 aa30.06■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 Q9D9H8 365 aa30.06■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 Bcl9Q9D219 1425 aa30.05■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 CenpjQ569L8 1344 aa30.04■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 P3h3Q8CG70 732 aa30.02■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa30.01■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slit3Q9WVB4 1523 aa30.01■■■□□ 2.4
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Stk26Q99JT2 416 aa30■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Anks4bQ8K3X6 423 aa29.99■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Alpk3Q924C5 1678 aa29.99■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Txndc2Q6P902 515 aa29.98■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Psme1P97371 249 aa29.96■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Abca14E9Q8F8 1683 aa29.95■■■□□ 2.39
Opn3-201ENSMUST00000027809 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms