RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rims1Q99NE5 1463 aa26.07■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rsph4aQ8BYM7 716 aa26.06■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myom2Q14BI5 1463 aa26.05■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NpatQ8BMA5 1420 aa26.05■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm13695A2AK44 830 aa26.05■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kdm2aP59997 1161 aa26.05■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stra8P70278 393 aa26.05■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Uggt1Q6P5E4 1551 aa26.03■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Os9Q8K2C7 672 aa26.02■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Anks4bQ8K3X6 423 aa26.02■■□□□ 1.76
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Qser1A2BIE1 1698 aa26■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm20521D3Z5F7 333 aa26■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myo3aQ8K3H5 1613 aa25.99■■□□□ 1.75
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa25.97■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zbtb4Q5F293 982 aa25.97■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mroh1E0CZ22 1640 aa25.96■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pola1P33609 1465 aa25.96■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Srcin1Q9QWI6 1250 aa25.96■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa25.95■■□□□ 1.75
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc24a1Q91WD8 1130 aa25.95■■□□□ 1.74
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hfm1D3Z4R1 1434 aa25.95■■□□□ 1.74
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stard8Q8K031 1019 aa25.94■■□□□ 1.74
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Skint5A7XUY5 1461 aa25.94■■□□□ 1.74
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa25.92■■□□□ 1.74
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa25.9■■□□□ 1.74
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa25.87■■□□□ 1.73
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa25.86■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa25.86■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 DnmbpQ6TXD4 1580 aa25.85■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mrs2Q5NCE8 434 aa25.85■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AU022751B1B0V2 589 aa25.84■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp40Q8BWR4 1235 aa25.84■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Exoc6Q8R313 802 aa25.84■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sbno1Q689Z5 1390 aa25.83■■□□□ 1.73
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa25.83■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc52a2Q9D8F3 450 aa25.8■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PrxO55103 1391 aa25.79■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif13aQ9EQW7 1749 aa25.77■■□□□ 1.72
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lrrc7Q80TE7 1490 aa25.76■■□□□ 1.71
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 NrdcQ8BHG1 1161 aa25.76■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pank3Q8R2W9 370 aa25.76■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tmf1B9EKI3 1091 aa25.75■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PtprmP28828 1452 aa25.74■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PalldQ9ET54 1408 aa25.74■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa25.73■■□□□ 1.71
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ift172Q6VH22 1749 aa25.71■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Naip7Q9JIB3 1402 aa25.69■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dnajc5gQ8C632 165 aa25.69■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc4a1apE9PX68 744 aa25.68■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 IqubQ8CDK3 788 aa25.68■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Inpp5dQ9ES52 1191 aa25.68■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zscan10Q3URR7 782 aa25.68■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stag3O70576 1240 aa25.66■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam184bQ0KK56 942 aa25.66■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf710Q3U288 666 aa25.66■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa25.65■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa25.65■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arhgef28P97433 1693 aa25.64■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp1b4Q99ME6 356 aa25.64■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tnnt3Q9QZ47 272 aa25.64■■□□□ 1.7
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa25.63■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MaddQ80U28 1577 aa25.62■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Shq1Q7TMX5 569 aa25.61■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa25.6■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plppr3Q7TPB0 716 aa25.6■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa25.59■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CenpjQ569L8 1344 aa25.58■■□□□ 1.68
Ldb1-201ENSMUST00000026252 InsrP15208 1372 aa25.55■■□□□ 1.68
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 P3h3Q8CG70 732 aa25.53■■□□□ 1.68
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stk26Q99JT2 416 aa25.53■■□□□ 1.68
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa25.51■■□□□ 1.68
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q9D9H8 365 aa25.5■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tex14Q7M6U3 1450 aa25.47■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plekhg1F6S200 1446 aa25.47■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dip2aQ8BWT5 1523 aa25.47■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cep170bQ80U49 1574 aa25.45■■□□□ 1.67
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zscan21Q07231 555 aa25.45■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa25.43■■□□□ 1.66
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Psme1P97371 249 aa25.43■■□□□ 1.66
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