RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa22.62■■□□□ 1.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hfm1D3Z4R1 1434 aa22.62■■□□□ 1.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.61■■□□□ 1.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Card11Q8CIS0 1159 aa22.61■■□□□ 1.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Uggt1Q6P5E4 1551 aa22.58■■□□□ 1.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ncoa1P70365 1447 aa22.58■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Skint5A7XUY5 1461 aa22.57■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mroh1E0CZ22 1640 aa22.55■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rims1Q99NE5 1463 aa22.55■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.53■■□□□ 1.2
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif13aQ9EQW7 1749 aa22.5■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myo3aQ8K3H5 1613 aa22.5■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa22.49■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa22.48■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kdm2aP59997 1161 aa22.47■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa22.46■■□□□ 1.19
Casq1-201ENSMUST00000003554 AU022751B1B0V2 589 aa22.45■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 PtprmP28828 1452 aa22.44■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa22.44■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Setd1aE9PYH6 1716 aa22.43■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Os9Q8K2C7 672 aa22.41■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm20521D3Z5F7 333 aa22.4■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rock2P70336 1388 aa22.4■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa22.39■■□□□ 1.18
Casq1-201ENSMUST00000003554 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Naip7Q9JIB3 1402 aa22.38■■□□□ 1.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zbtb4Q5F293 982 aa22.37■■□□□ 1.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fan1Q69ZT1 1020 aa22.37■■□□□ 1.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plekhg5Q66T02 1073 aa22.35■■□□□ 1.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pola1P33609 1465 aa22.33■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dip2bQ3UH60 1574 aa22.32■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 DnmbpQ6TXD4 1580 aa22.32■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Srcin1Q9QWI6 1250 aa22.31■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa22.31■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nphp4P59240 1425 aa22.3■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arhgef28P97433 1693 aa22.3■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Alpk3Q924C5 1678 aa22.29■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp40Q8BWR4 1235 aa22.29■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc52a2Q9D8F3 450 aa22.29■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc7Q80TE7 1490 aa22.28■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa22.28■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ift172Q6VH22 1749 aa22.27■■□□□ 1.16
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa22.26■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 PplQ9R269 1755 aa22.26■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stard8Q8K031 1019 aa22.25■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22.25■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.22■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa22.22■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 PalldQ9ET54 1408 aa22.22■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Shq1Q7TMX5 569 aa22.22■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.22■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa22.21■■□□□ 1.15
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Casq1-201ENSMUST00000003554 P3h3Q8CG70 732 aa22.2■■□□□ 1.14
Casq1-201ENSMUST00000003554 MaddQ80U28 1577 aa22.19■■□□□ 1.14
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9D9H8 365 aa22.16■■□□□ 1.14
Casq1-201ENSMUST00000003554 Txndc2Q6P902 515 aa22.15■■□□□ 1.14
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dip2aQ8BWT5 1523 aa22.14■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stag3O70576 1240 aa22.13■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 MyclP10166 368 aa22.13■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bcl9Q9D219 1425 aa22.13■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 IqubQ8CDK3 788 aa22.13■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sbno1Q689Z5 1390 aa22.12■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psme1P97371 249 aa22.12■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep170bQ80U49 1574 aa22.11■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stk26Q99JT2 416 aa22.11■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 PrxO55103 1391 aa22.11■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Asxl2Q8BZ32 1370 aa22.1■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm13695A2AK44 830 aa22.08■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 Topaz1E5FYH1 1653 aa22.08■■□□□ 1.13
Casq1-201ENSMUST00000003554 IghaA0A0A6YXW6 389 aa22.07■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pank3Q8R2W9 370 aa22.07■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slit3Q9WVB4 1523 aa22.06■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc4a1apE9PX68 744 aa22.05■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plekhg1F6S200 1446 aa22.03■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abca14E9Q8F8 1683 aa22.03■■□□□ 1.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmf1B9EKI3 1091 aa22.01■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Inpp5dQ9ES52 1191 aa22.01■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 CenpjQ569L8 1344 aa22.01■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa22■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 InsrP15208 1372 aa21.99■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam184bQ0KK56 942 aa21.99■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zscan10Q3URR7 782 aa21.97■■□□□ 1.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa21.97■■□□□ 1.11
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