RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W XBP1P40489 647 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W URM1P40554 99 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YPS5P53057 165 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YGL230CP53074 147 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YNL092WP53934 400 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W LSM3P57743 89 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YML053CQ04978 212 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W MRX8Q05473 314 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YLR177WQ06251 628 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W IZH3Q07959 543 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YLR049CQ12110 428 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
YPT53YNL093W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W FMP49A0A023PZB3 126 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W STP22P25604 385 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W ATS1P31386 333 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W TOA2P32774 122 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W PMU1P36069 295 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SHB17P36136 271 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YBR053CP38235 358 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YHL044WP38727 235 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W AVT6P40074 448 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W HMS2P47175 358 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W UBC12P52491 188 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W ATP23P53722 227 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W SPR6Q01684 191 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W TAZ1Q06510 381 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W YDL218WQ07629 317 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W TFC7Q12415 435 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W EAF3Q12432 401 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W PRM4Q12498 284 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.47□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
YPT53YNL093W RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SGA1P08019 549 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SNF4P12904 322 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W CAP2P13517 287 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MSI1P13712 422 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W UBC5P15732 148 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MDM10P18409 493 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MAG1P22134 296 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YCR007CP25354 239 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MED6P38782 295 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YEL075CP39972 122 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YER189WP40104 122 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YFR054CP43622 192 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SBH1P52870 82 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W VPS28Q02767 242 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W RNH202Q05635 350 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W IES4Q08561 116 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W FDH1Q08911 376 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SPC3Q12133 184 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YOR342CQ12182 319 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YPK9Q12697 1472 aa3.46□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SPO12P17123 173 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W ANB1P19211 157 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MRPL9P31334 269 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W PEX2P32800 271 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TKL2P33315 681 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YKL102CP34249 101 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W ETR1P38071 380 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W DFG10P40526 253 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SFT1P43682 97 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YJL043WP47053 257 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TTI2P47168 421 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W DIE2P50076 525 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MUP1P50276 574 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W UBC13P52490 153 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MDM34P53083 459 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TOS8P53147 276 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YGR015CP53208 328 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W PCP1P53259 346 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W APJ1P53940 528 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W VPS71Q03433 280 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SPG4Q04438 115 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W COQ10Q08058 207 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W DGA1Q08650 418 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W MCP1Q12106 302 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W RFM1Q12192 310 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W VPS15P22219 1454 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TY1B-BRQ12193 1756 aa3.45□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W TIR1P10863 254 aa3.44□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W RPL30P14120 105 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SRP21P32342 167 aa3.44□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W SRB6P32570 121 aa3.44□□□□□ -1.86
YPT53YNL093W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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