RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	INO4	P13902	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	CDC26	P14724	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SFK1	P35735	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SDH4	P37298	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	MOH1	P38191	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	GLE2	P40066	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	VMA21	P41806	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SAY1	P53324	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SWC7	Q06707	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	MCT1	Q12283	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ORT1	Q12375	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	HUT1	Q12520	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	RAD6	P06104	172 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	OAC1	P32332	324 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	IES6	P32617	166 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ELO1	P39540	310 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	VFA1	P40080	203 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ATG18	P43601	500 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	AVT1	P47082	602 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YGR168C	P53293	376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	PEX27	Q08580	376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ACM1	Q08981	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YLR415C	O13578	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ACB1	P31787	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YBR241C	P38142	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
VBA1	YMR088C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YGL230C	P53074	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	MTL1	P53214	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	PIN3	Q06449	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NAT5	Q08689	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SAM35	P14693	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RTC2	P38279	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	GET2	P40056	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YFR020W	P43600	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	OST3	P48439	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	UBC11	P52492	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YNL095C	P53932	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	GPI15	P53961	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	POS5	Q06892	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	PAU23	Q07987	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	PAU17	Q12370	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	REC114	P32841	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YKL187C	P34231	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ARN2	P38724	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	VHS2	P40463	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	FLX1	P40464	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YIL059C	P40520	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	POP1	P41812	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SNO3	P43544	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	MOB2	P43563	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SBH1	P52870	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ERV29	P53337	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SNO2	P53823	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RSM10	Q03201	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	LOA1	Q06508	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	CHO1	P08456	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	UBC5	P15732	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YCR007C	P25354	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YCR100C	P25606	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YSC83	P32792	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ZRT3	P34240	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	AVT7	P40501	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	GON7	P46984	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	MRX11	Q03079	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	INM2	Q05533	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms