RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL25P04456 142 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C KIN28P06242 306 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C ADK1P07170 222 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C QCR2P07257 368 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C GDH1P07262 454 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YER190C-BP0CX94 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YEL077W-AP0CX95 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR296C-BP0CX96 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL283W-BP0CX97 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR204C-AP0CX98 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YFL068WP0CX99 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YLL066W-AP0CY00 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YLL067W-AP0CY01 160 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C HEM13P11353 328 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C TAL1P15019 335 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C URA6P15700 204 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SEN2P16658 377 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR31P19955 123 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPS28P21771 286 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C MSN1P22148 382 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C PRE9P23638 258 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C ROX3P25046 220 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SBA1P28707 216 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C PRE4P30657 266 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C VMA5P31412 392 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C ACH1P32316 526 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C COQ2P32378 372 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C FPR2P32472 135 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C UTR5P32630 166 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C MTC7P32633 139 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C REC104P33323 182 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SPC29P33419 253 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC66P33754 206 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YKL063CP35725 167 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data0.56□□□□□ -2.32not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C EDS1P38073 919 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C FIG1P38224 298 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C ALG14P38242 237 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS20P38701 121 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C OSH7P38755 437 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C IKI1P38874 309 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C GLE2P40066 365 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YER188WP40103 239 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL194CP40169 301 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SDP1P40479 209 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C FMC1P40491 155 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YKE4P40544 346 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC24P40580 263 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL213WP40896 331 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C OTU1P43558 301 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL163CP46996 555 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C PIR5P46999 287 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C LSM1P47017 172 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YHC3P47040 408 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL016WP47072 561 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C GPI14P47088 403 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C EFM3P47163 339 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C TTI2P47168 421 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RBL2P48606 106 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C LYS5P50113 272 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SOL1P50278 321 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG25P53045 309 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RAI1P53063 387 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C NIF3P53081 288 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL114WP53134 725 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C MRH4P53166 561 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR045CP53229 120 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C COX18P53239 316 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C VHT1P53241 593 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C VOA1P53262 265 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C OKP1P53298 406 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C ERV29P53337 310 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YNR064CP53750 290 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL234WP53857 426 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C APJ1P53940 528 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C HSK3P69852 69 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL067CQ02754 198 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL077CQ02831 240 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C MAK3Q03503 176 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR248CQ03786 193 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C GPI17Q04080 534 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YHP1Q04116 353 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C CAC2Q04199 468 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C FIT1Q04433 528 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C SPG4Q04438 115 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR114CQ04597 100 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR286CQ05530 114 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C LIP2Q06005 328 aa0.56□□□□□ -2.32
tT(AGU)CtT(AGU)C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.6 ms