RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B TPK3P05986 398 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPC40P07703 335 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPB3P16370 318 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PRP28P23394 588 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B IFM1P25038 676 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B OCA4P25366 362 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B IMP1P28627 190 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data0.31□□□□□ -2.36not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B NPL6P32832 435 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YKT6P36015 200 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B VBA2P38358 474 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MDM31P38880 579 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ARB1P40024 610 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YER076CP40049 302 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NSA2P40078 261 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PUG1P40100 303 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B EMC5P40540 141 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B STB1P42845 420 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MCM22P47167 239 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B UBP8P50102 471 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR021WP53212 290 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B COG2P53271 262 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NOP19P53317 196 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FMP41P53889 259 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HHT1P61830 136 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HSK3P69852 69 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NUP49Q02199 472 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YKR005CQ02203 525 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B DML1Q03652 475 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CSN9Q03981 162 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NEJ1Q06148 342 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B DBP9Q06218 594 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL114WQ07530 308 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RRT7Q07829 113 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B DCI1Q08558 271 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL162CQ12042 273 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B VIK1Q12045 647 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ULA1Q12059 462 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B AEP3Q12089 606 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR1Q12458 312 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR011W-AQ3E807 68 aa0.31□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR415CO13578 112 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR156WP0CE96 114 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR159WP0CE97 114 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR161WP0CE98 114 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MRP1P10662 321 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B GPA2P10823 449 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B DPM1P14020 267 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SPO12P17123 173 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B STE18P18852 110 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ZRC1P20107 442 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CLB3P24870 427 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B TFC1P32367 649 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YEL045CP32616 141 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FZF1P32805 299 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPB7P34087 171 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ELF1P36053 145 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SRP102P36057 244 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL3P36516 390 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B BIG1P38813 335 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CCT4P39078 528 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FCY21P40039 528 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B GLE2P40066 365 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B AVT6P40074 448 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YER135CP40082 130 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR134WP40207 237 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SDP1P40479 209 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MET28P40573 187 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B IGD1P43598 195 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FAR3P46671 204 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MRX5P47007 382 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HNT2P49775 206 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG9P53868 555 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B OCA2P53949 197 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SRL4Q03085 281 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR210WQ03482 75 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B BET5Q03630 159 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ASM4Q05166 528 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YHC1Q05900 231 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FIT2Q08906 153 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MPD1Q12404 318 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B TFC7Q12415 435 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B EAF3Q12432 401 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR030W-AQ3E760 96 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR240C-AQ3E786 66 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B KSH1Q8TGJ3 72 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RIB3Q99258 208 aa0.3□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR462WO13556 202 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL25P04456 142 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL9AP05738 191 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SNF4P12904 322 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RFA1P22336 621 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B COQ3P27680 312 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NTG1P31378 399 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YET1P35723 206 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SRY1P36007 326 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RCN1P36054 211 aa0.29□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YKL077WP36081 392 aa0.29□□□□□ -2.36
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